概括
基因 10401
象征 PIAS3
同义词 Zmiz5
描述 活化stat 3的蛋白抑制剂
参考 MIM:605987|HGNC:HGNC:16861|ENSEMBL:ENSG00000131788|HPRD:09068|Vega:Otthumg0000000013750
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21
Sherlock P值 0.033
胎儿β -0.278
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 PIAS3 10401 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FHL1 0.83 0.84
纳迦 0.83 0.79
GLB1 0.82 0.79
HeaTr2 0.81 0.85
sall2 0.81 0.81
RP11-369J21.1 0.80 0.77
TCTN1 0.79 0.72
TCTN3 0.79 0.72
多克 0.79 0.80
C1orf56 0.78 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.59 -0.68
MT-CO2 -0.59 -0.67
AF347015.21 -0.58 -0.71
AF347015.8 -0.57 -0.67
AF347015.31 -0.57 -0.66
AF347015.33 -0.56 -0.64
mt-cyb -0.54 -0.63
AC098691.2 -0.53 -0.62
MT-ATP8 -0.51 -0.70
AF347015.2 -0.51 -0.64

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003676 核酸结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0051059 NF-kappab结合 IPI 15140884
GO:0019789 相扑酶活性 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
GO:0016925 蛋白质sumoylation IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
GO:0016607 核斑点 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ar AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM 雄激素受体 两个杂交 Biogrid 11117529
克雷布 CBP |kat3a |RST CREB结合蛋白 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14691252
EP300 kat3b |P300 E1a结合蛋白p300 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14691252
双子座4 DKFZP434B131 |DKFZP434D174 |HC56 |HCAP1 |HHRF-1 |P97 宝石(核管细胞器)相关蛋白4 HCAP1与PIAS3相互作用3 绑定 12869526
GFI1 FLJ94509 |GFI-1 |ZNF163 生长因子独立1转录阻遏物 两个杂交 Biogrid 11060035
HDAC1 DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 - HPRD 14691252
HMGA2 BABL |HMGI-C |HMGIC |Lipo |STQTL9 高移动性小组AT-HOK 2 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 11390395
mitf mi |WS2A |Bhlhe32 微粒细胞相关的转录因子 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 11709556
Rela MGC131774 |NFKB3 |P65 V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 15140884
Smad2 JV18 |JV18-1 |madh2 |Madr2 |MGC22139 |MGC34440 |HMAD-2 |HSMAD2 SMAD家庭成员2 - HPRD,Biogrid 14691252
Smad3 DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 SMAD家庭成员3 - HPRD,Biogrid 14691252
Smad4 DPC4 |jip |madh4 SMAD家庭成员4 - HPRD,Biogrid 14691252
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) - HPRD 11429412|12804609
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) - HPRD,Biogrid 11429412
ZFHX3 ATBF1 |ATBT 锌指同源3 ATBF1与PIAS3相互作用。 绑定 14715251


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG泛素介导的蛋白水解 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg jak stat信号通路 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小细胞肺癌 84 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
圣雅克统计途径 9 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST Stat3途径 11 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SMAD2 3核途径 82 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR途径 61 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL6 7途径 47 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB途径 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化 77 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化CCNE1 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化APOBEC2 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化12小时 43 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射3的响应3 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠与直肠癌DN 56 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟C 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Worschech肿瘤逃避和耐受性 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Duan PRDM5目标 79 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 238 244 M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-18 774 780 M8 HSA-MIR-18A uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18B uaaggugcaucuagugcagua
mir-181 916 922 M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-324-3p 263 269 M8 HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
mir-410 690 696 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-9 572 578 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga