基因页:PIAS3
概括?
基因 | 10401 |
象征 | PIAS3 |
同义词 | Zmiz5 |
描述 | 活化stat 3的蛋白抑制剂 |
参考 | MIM:605987|HGNC:HGNC:16861|ENSEMBL:ENSG00000131788|HPRD:09068|Vega:Otthumg0000000013750 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q21 |
Sherlock P值 | 0.033 |
胎儿β | -0.278 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | PIAS3 | 10401 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PIAS3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FHL1 | 0.83 | 0.84 |
纳迦 | 0.83 | 0.79 |
GLB1 | 0.82 | 0.79 |
HeaTr2 | 0.81 | 0.85 |
sall2 | 0.81 | 0.81 |
RP11-369J21.1 | 0.80 | 0.77 |
TCTN1 | 0.79 | 0.72 |
TCTN3 | 0.79 | 0.72 |
多克 | 0.79 | 0.80 |
C1orf56 | 0.78 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.59 | -0.68 |
MT-CO2 | -0.59 | -0.67 |
AF347015.21 | -0.58 | -0.71 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.67 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.56 | -0.64 |
mt-cyb | -0.54 | -0.63 |
AC098691.2 | -0.53 | -0.62 |
MT-ATP8 | -0.51 | -0.70 |
AF347015.2 | -0.51 | -0.64 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0051059 | NF-kappab结合 | IPI | 15140884 | |
GO:0019789 | 相扑酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
GO:0016925 | 蛋白质sumoylation | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
GO:0016607 | 核斑点 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ar | AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM | 雄激素受体 | 两个杂交 | Biogrid | 11117529 |
克雷布 | CBP |kat3a |RST | CREB结合蛋白 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14691252 |
EP300 | kat3b |P300 | E1a结合蛋白p300 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14691252 |
双子座4 | DKFZP434B131 |DKFZP434D174 |HC56 |HCAP1 |HHRF-1 |P97 | 宝石(核管细胞器)相关蛋白4 | HCAP1与PIAS3相互作用3 | 绑定 | 12869526 |
GFI1 | FLJ94509 |GFI-1 |ZNF163 | 生长因子独立1转录阻遏物 | 两个杂交 | Biogrid | 11060035 |
HDAC1 | DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰基酶1 | - | HPRD | 14691252 |
HMGA2 | BABL |HMGI-C |HMGIC |Lipo |STQTL9 | 高移动性小组AT-HOK 2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 11390395 |
mitf | mi |WS2A |Bhlhe32 | 微粒细胞相关的转录因子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 11709556 |
Rela | MGC131774 |NFKB3 |P65 | V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 15140884 |
Smad2 | JV18 |JV18-1 |madh2 |Madr2 |MGC22139 |MGC34440 |HMAD-2 |HSMAD2 | SMAD家庭成员2 | - | HPRD,Biogrid | 14691252 |
Smad3 | DKFZP586N0721 |DKFZP686J10186 |HSPC193 |HST17436 |JV15-2 |madh3 |MGC60396 | SMAD家庭成员3 | - | HPRD,Biogrid | 14691252 |
Smad4 | DPC4 |jip |madh4 | SMAD家庭成员4 | - | HPRD,Biogrid | 14691252 |
Stat3 | APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 | 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) | - | HPRD | 11429412|12804609 |
Stat3 | APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 | 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) | - | HPRD,Biogrid | 11429412 |
ZFHX3 | ATBF1 |ATBT | 锌指同源3 | ATBF1与PIAS3相互作用。 | 绑定 | 14715251 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小细胞肺癌 | 84 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
圣雅克统计途径 | 9 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST Stat3途径 | 11 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID SMAD2 3核途径 | 82 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AR途径 | 61 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL6 7途径 | 47 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CMYB途径 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化 | 77 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化CCNE1 | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化APOBEC2 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化12小时 | 43 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射3的响应3 | 48 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠与直肠癌DN | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟C | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A4 | 196 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Worschech肿瘤逃避和耐受性 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Duan PRDM5目标 | 79 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 238 | 244 | M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-18 | 774 | 780 | M8 | HSA-MIR-18A | uaagguggaugugcagaua |
HSA-MIR-18B | uaaggugcaucuagugcagua | ||||
mir-181 | 916 | 922 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-324-3p | 263 | 269 | M8 | HSA-MIR-324-3P | ccacugccccaggugcugcugg |
mir-410 | 690 | 696 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
mir-9 | 572 | 578 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |