基因页：ifitm3
Summary？
| 基因 | 10410 |
| 象征 | ifitm3 |
| 同义词 | 1-8U | DSPA2B | IP15 |
| 描述 | 干扰素诱导的跨膜蛋白3 |
| Reference | MIM:605579|HGNC：HGNC：5414|Ensembl：ENSG00000142089|HPRD：05719|Vega:OTTHUMG00000165542 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11P15.5 |
| Pascal P值 | 0.85 |
| Sherlock p-value | 0.002 |
| DEG P值 | DEG：SANDERS_2014：DS1_P = 0.172：DS1_BETA = 0.012300：DS2_P = 3.07E-02：DS2_BETA = -0.106：DS2_FDR = 1.46E-01 |
| 胎儿β | -1.138 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 Hypothalamus 伏隔核基底神经节 硬膜基底ganglia |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DEG:Sanders_2013 | 微阵列 | 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。 | |
| PMID：cooccur | High-throughput literature-search | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 表达 | Meta-analysis of gene expression | p价值：1.656 | |
| Literature | High-throughput literature-search | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6421983 | 11 | 320394 | ifitm3 | ENSG00000142089.11 | 4.91076E-7 | 0 | 946 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34481144 | 11 | 320836 | ifitm3 | ENSG00000142089.11 | 4.20051E-7 | 0 | 504 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7479267 | 11 | 320988 | ifitm3 | ENSG00000142089.11 | 2.70928E-6 | 0 | 352 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56232455 | 11 | 321235 | ifitm3 | ENSG00000142089.11 | 2.19272E-7 | 0 | 105 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56228238 | 11 | 321320 | ifitm3 | ENSG00000142089.11 | 1.32289E-8 | 0 | 20 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7948108 | 11 | 323507 | ifitm3 | ENSG00000142089.11 | 1.26841E-6 | 0 | -2167 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7944394 | 11 | 323649 | ifitm3 | ENSG00000142089.11 | 1.44502E-6 | 0 | -2309 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| mettl3 | 0.85 | 0.84 |
| GLT8D1 | 0.85 | 0.85 |
| ilkap | 0.84 | 0.87 |
| SNRPA1 | 0.83 | 0.81 |
| Znf7 | 0.83 | 0.84 |
| ngdn | 0.82 | 0.84 |
| polr1c | 0.82 | 0.83 |
| IFT20 | 0.82 | 0.82 |
| CYP2R1 | 0.82 | 0.85 |
| ZNF133 | 0.81 | 0.83 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| mt-cyb | -0.70 | -0.73 |
| AF347015.15 | -0.70 | -0.74 |
| AF347015.27 | -0.70 | -0.72 |
| AF347015.8 | -0.70 | -0.72 |
| AF347015.2 | -0.70 | -0.75 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.70 |
| AF347015.31 | -0.69 | -0.70 |
| AF347015.33 | -0.68 | -0.71 |
| AF347015.26 | -0.67 | -0.74 |
| AF347015.9 | -0.63 | -0.70 |
第三节。基因本体论注释
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0009607 | 对生物刺激的反应 | IEA | - | |
| 去：0006955 | 免疫反应 | TAS | 1906403 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 18029348 | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 11256614 |