概括
基因 10423
象征 CDIPT
同义词 pis | pis1
描述 CDP-二酰甘油 - 肌醇3-磷脂酰转移酶
参考 MIM:605893|HGNC:HGNC:1769|Ensembl:ENSG00000103502|HPRD:12063|Vega:Otthumg00000177144
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p11.2
Pascal P值 0.01
Sherlock P值 0.408
胎儿β -0.606
主持人 小脑
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
U2AF2 0.95 0.96
strn4 0.95 0.97
Men1 0.95 0.95
RBM15B 0.94 0.96
EHMT2 0.94 0.94
马兹 0.93 0.93
威兹 0.93 0.94
DCAF15 0.93 0.95
DVL3 0.93 0.94
SARM1 0.93 0.96
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.78 -0.88
AF347015.27 -0.78 -0.89
MT-CO2 -0.77 -0.89
AF347015.33 -0.77 -0.88
mt-cyb -0.75 -0.86
AF347015.8 -0.74 -0.88
S100B -0.74 -0.84
FXYD1 -0.73 -0.83
HLA-F -0.72 -0.76
AF347015.15 -0.72 -0.85

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0003881 CDP二酰甘油氨基醇3-磷脂酰转移酶活性 IEA -
GO:0016780 其他取代磷酸基团的磷酸转移酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008526 磷脂酰肌醇转运蛋白活性 塔斯 9407135
GO:0030145 锰离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008654 磷脂生物合成过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG肌醇磷酸代谢 54 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG甘油磷脂代谢 77 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 76 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scibetta KDM5B靶向 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 108 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-214 116 122 M8 HSA-MIR-214 acagcaggcacagacaggcag