基因页:CDIPT
概括?
基因 | 10423 |
象征 | CDIPT |
同义词 | pis | pis1 |
描述 | CDP-二酰甘油 - 肌醇3-磷脂酰转移酶 |
参考 | MIM:605893|HGNC:HGNC:1769|Ensembl:ENSG00000103502|HPRD:12063|Vega:Otthumg00000177144 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p11.2 |
Pascal P值 | 0.01 |
Sherlock P值 | 0.408 |
胎儿β | -0.606 |
主持人 | 小脑 |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CDIPT_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
U2AF2 | 0.95 | 0.96 |
strn4 | 0.95 | 0.97 |
Men1 | 0.95 | 0.95 |
RBM15B | 0.94 | 0.96 |
EHMT2 | 0.94 | 0.94 |
马兹 | 0.93 | 0.93 |
威兹 | 0.93 | 0.94 |
DCAF15 | 0.93 | 0.95 |
DVL3 | 0.93 | 0.94 |
SARM1 | 0.93 | 0.96 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.78 | -0.88 |
AF347015.27 | -0.78 | -0.89 |
MT-CO2 | -0.77 | -0.89 |
AF347015.33 | -0.77 | -0.88 |
mt-cyb | -0.75 | -0.86 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.88 |
S100B | -0.74 | -0.84 |
FXYD1 | -0.73 | -0.83 |
HLA-F | -0.72 | -0.76 |
AF347015.15 | -0.72 | -0.85 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0003881 | CDP二酰甘油氨基醇3-磷脂酰转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0016780 | 其他取代磷酸基团的磷酸转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008526 | 磷脂酰肌醇转运蛋白活性 | 塔斯 | 9407135 | |
GO:0030145 | 锰离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008654 | 磷脂生物合成过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG肌醇磷酸代谢 | 54 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG甘油磷脂代谢 | 77 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组甘油磷脂生物合成 | 82 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Scibetta KDM5B靶向 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 | 108 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 | 151 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病持续时间corr dn | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-214 | 116 | 122 | M8 | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |