基因页:Zer1
概括?
基因 | 10444 |
象征 | Zer1 |
同义词 | c9orf60 | zyg | zyg11bl |
描述 | ZYG-11相关,细胞周期调节剂 |
参考 | HGNC:HGNC:30960|ENSEMBL:ENSG00000160445|HPRD:10802|Vega:Otthumg00000020759 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q34.11 |
Pascal P值 | 4.134E-5 |
Sherlock P值 | 0.01 |
胎儿β | -0.66 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2088626 | CHR5 | 10459554 | Zer1 | 10444 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZER1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ACAP1 | 0.68 | 0.52 |
C11orf83 | 0.67 | 0.62 |
polr2l | 0.66 | 0.68 |
C9orf24 | 0.64 | 0.54 |
ptrh1 | 0.63 | 0.50 |
SSNA1 | 0.62 | 0.56 |
PEX11G | 0.62 | 0.48 |
IFI27L1 | 0.62 | 0.60 |
DPM3 | 0.61 | 0.64 |
polr2i | 0.61 | 0.61 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC016910.1 | -0.41 | -0.47 |
NFAT5 | -0.37 | -0.44 |
SLC20A1 | -0.37 | -0.42 |
PLCL1 | -0.37 | -0.46 |
DNM3 | -0.36 | -0.40 |
nuak1 | -0.36 | -0.39 |
mysm1 | -0.36 | -0.42 |
KIAA0430 | -0.36 | -0.43 |
USP31 | -0.36 | -0.39 |
TTBK2 | -0.36 | -0.42 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王食道癌与正常DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A4 | 196 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist NRAS与基质刺激 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌晚期复发DN | 69 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗HCMV感染30分钟 | 56 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |