基因页：CDX2
概括？
| 基因 | 1045 |
| 象征 | CDX2 |
| 同义词 | CDX-3 | CDX2/AS | CDX3 |
| 描述 | 尾型同源2 |
| 参考 | MIM：600297|HGNC：HGNC：1806|HPRD：02622| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13Q12.3 |
| Pascal P值 | 0.936 |
| 胎儿β | -0.413 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02550231 | 13 | 28542287 | CDX2 | 7.96E-7 | -0.923 | 0.007 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT2A | 0.80 | 0.70 |
| srgn | 0.79 | 0.79 |
| ifitm2 | 0.78 | 0.76 |
| C13orf15 | 0.77 | 0.77 |
| C10orf54 | 0.76 | 0.79 |
| MT1A | 0.75 | 0.67 |
| GADD45B | 0.74 | 0.82 |
| ifitm3 | 0.74 | 0.74 |
| MT1P2 | 0.73 | 0.66 |
| atoh8 | 0.73 | 0.74 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AGPAT6 | -0.53 | -0.59 |
| FHOD3 | -0.51 | -0.57 |
| ing2 | -0.51 | -0.57 |
| RTF1 | -0.51 | -0.61 |
| ikbkap | -0.51 | -0.56 |
| rnasen | -0.51 | -0.59 |
| USP7 | -0.51 | -0.50 |
| TP53BP1 | -0.51 | -0.54 |
| IWS1 | -0.51 | -0.57 |
| SUPV3L1 | -0.51 | -0.60 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 能量代谢的反应组整合 | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胰岛素分泌的反应组调节 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome泌尿素合成分泌和失活 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome合成分泌和GLP1的失活 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 结肠癌中的施莱辛格甲基化 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlesinger甲基化的癌症 | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahajan对IL1A的回应 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的甲基化 | 56 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K27Me3 | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1和SATB1的Purbey目标 | 87 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kohoutek CCNT2目标 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |