基因页:ECI2
Summary?
基因 | 10455 |
象征 | ECI2 |
同义词 | acbd2 | drs-1 | drs1 | hca88 | peci | dj1013a10.3 |
描述 | Enoyl-COA三角洲异构酶2 |
参考 | MIM:608024|HGNC:HGNC:14601|ENSEMBL:ENSG00000198721|HPRD:16269|Vega:Otthumg0000000014158 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p24.3 |
Pascal P值 | 0.018 |
Sherlock P值 | 0.446 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10080424 | 6 | 4079581 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.811E-6 | 0.01 | 56250 | gtex_brain_ba24 |
RS62394175 | 6 | 4104898 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 9.189E-7 | 0.01 | 30933 | gtex_brain_ba24 |
RS1359321 | 6 | 4107486 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.027E-6 | 0.01 | 28345 | gtex_brain_ba24 |
RS1815510 | 6 | 4108754 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 7.091E-7 | 0.01 | 27077 | gtex_brain_ba24 |
RS2326403 | 6 | 4108932 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.43E-6 | 0.01 | 26899 | gtex_brain_ba24 |
RS1832059 | 6 | 4113219 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.43E-6 | 0.01 | 22612 | gtex_brain_ba24 |
RS71553907 | 6 | 4118979 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.148E-6 | 0.01 | 16852 | gtex_brain_ba24 |
RS9503919 | 6 | 4118984 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.43E-6 | 0.01 | 16847 | gtex_brain_ba24 |
RS9503922 | 6 | 4121333 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 7.091E-7 | 0.01 | 14498 | gtex_brain_ba24 |
RS3177253 | 6 | 4133855 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 3.243E-7 | 0.01 | 1976年 | gtex_brain_ba24 |
RS35071107 | 6 | 4135225 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.115E-7 | 0.01 | 606 | gtex_brain_ba24 |
RS45529732 | 6 | 4135262 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.307E-6 | 0.01 | 569 | gtex_brain_ba24 |
RS13437317 | 6 | 4145203 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.642E-6 | 0.01 | -9372 | gtex_brain_ba24 |
RS62394175 | 6 | 4104898 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.321E-8 | 0 | 30933 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6597031 | 6 | 4106370 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.619E-7 | 0 | 29461 | gtex_brain_putamen_basal |
RS619873 | 6 | 4107455 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 4.82e-9 | 0 | 28376 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1359321 | 6 | 4107486 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.195E-8 | 0 | 28345 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1815510 | 6 | 4108754 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.59E-8 | 0 | 27077 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2326403 | 6 | 4108932 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 4.884e-9 | 0 | 26899 | gtex_brain_putamen_basal |
rs649725 | 6 | 4109593 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.79E-9 | 0 | 26238 | gtex_brain_putamen_basal |
RS853416 | 6 | 4113047 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 22784 | gtex_brain_putamen_basal |
RS853417 | 6 | 4113123 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.123E-10 | 0 | 22708 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1832059 | 6 | 4113219 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 3.231E-9 | 0 | 22612 | gtex_brain_putamen_basal |
RS620484 | 6 | 4114211 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.123E-10 | 0 | 21620 | gtex_brain_putamen_basal |
RS634698 | 6 | 4114247 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.123E-10 | 0 | 21584 | gtex_brain_putamen_basal |
rs633290 | 6 | 4114788 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.496E-9 | 0 | 21043 | gtex_brain_putamen_basal |
RS617790 | 6 | 4115758 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.697E-9 | 0 | 20073 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7166 | 6 | 4116262 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 19569 | gtex_brain_putamen_basal |
RS397746811 | 6 | 4117314 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.424e-8 | 0 | 18517 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2783073 | 6 | 4118674 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 17157 | gtex_brain_putamen_basal |
RS584585 | 6 | 4118789 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.123E-10 | 0 | 17042 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71553907 | 6 | 4118979 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.145e-8 | 0 | 16852 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9503919 | 6 | 4118984 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 3.231E-9 | 0 | 16847 | gtex_brain_putamen_basal |
RS659025 | 6 | 4119051 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.123E-10 | 0 | 16780 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7757606 | 6 | 4119704 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.123E-10 | 0 | 16127 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7744628 | 6 | 4119996 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 15835 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9328220 | 6 | 4120181 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 15650 | gtex_brain_putamen_basal |
RS693953 | 6 | 4120565 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 15266 | gtex_brain_putamen_basal |
RS613260 | 6 | 4120567 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 15264 | gtex_brain_putamen_basal |
RS613709 | 6 | 4120683 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 4.057E-10 | 0 | 15148 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9503922 | 6 | 4121333 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 5.736E-10 | 0 | 14498 | gtex_brain_putamen_basal |
RS629362 | 6 | 4121831 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 14000 | gtex_brain_putamen_basal |
RS643232 | 6 | 4122249 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 13582 | gtex_brain_putamen_basal |
RS659305 | 6 | 4125655 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.327E-9 | 0 | 10176 | gtex_brain_putamen_basal |
RS660560 | 6 | 4125941 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.407E-9 | 0 | 9890 | gtex_brain_putamen_basal |
RS612022 | 6 | 4126916 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.885e-9 | 0 | 8915 | gtex_brain_putamen_basal |
RS676683 | 6 | 4127253 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.09E-9 | 0 | 8578 | gtex_brain_putamen_basal |
RS689308 | 6 | 4127730 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 2.461E-9 | 0 | 8101 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3177253 | 6 | 4133855 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 3.893E-8 | 0 | 1976年 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35071107 | 6 | 4135225 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 1.556E-8 | 0 | 606 | gtex_brain_putamen_basal |
RS45529732 | 6 | 4135262 | ECI2 | ENSG00000198721.8 | 6.763E-9 | 0 | 569 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ECI2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
补充说明:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
asxl1 | 0.92 | 0.93 |
RAF1 | 0.92 | 0.92 |
dclre1b | 0.92 | 0.90 |
rspry1 | 0.92 | 0.93 |
KDM4A | 0.92 | 0.93 |
ZNF828 | 0.92 | 0.94 |
USP10 | 0.92 | 0.94 |
NCOA5 | 0.92 | 0.94 |
ISG20L2 | 0.91 | 0.94 |
TCEB3 | 0.91 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
S100B | -0.76 | -0.88 |
AIFM3 | -0.76 | -0.79 |
HLA-F | -0.76 | -0.80 |
C5orf53 | -0.75 | -0.77 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.89 |
FXYD1 | -0.74 | -0.90 |
MT-CO2 | -0.74 | -0.91 |
TSC22D4 | -0.74 | -0.81 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.88 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.88 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000062 | 酰基-COA结合 | IEA | - | |
去:0004165 | 十二烯酰基-COA三角洲异构酶活性 | IEA | - | |
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
GO:0016853 | 异构酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0006631 | 脂肪酸代谢过程 | 塔斯 | 10419495 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005739 | 线粒体 | 艾达 | 11256614 | |
去:0005777 | 过氧化物酶体 | 塔斯 | 10419495 | |
去:0005782 | peroxisomal matrix | IEA | - |