基因页面:BAIAP2
总结吗?
| GeneID | 10458年 |
| 象征 | BAIAP2 |
| 同义词 | BAP2 | FLAF3 | IRSP53 |
| 描述 | BAI1相关蛋白2 |
| 参考 | MIM: 605475|HGNC: HGNC: 947|运用:ENSG00000175866|HPRD: 05686|织女:OTTHUMG00000177698 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 17 q25 |
| 帕斯卡假定值 | 0.015 |
| 夏洛克假定值 | 0.596 |
| 胎儿β | -1.424 |
| 支持 | 细胞内信号转导 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS g2cdb.human_tap psd - 95核心 G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet 潜在的突触基因 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:4 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BAIAP2 | chr17 | 79080665 | C | G | NM_001144888 NM_006340 NM_017450 NM_017451 |
p.486F > L p.486F > L p.486F > L p.486F > L |
错义 错义 错义 错义 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 | ||
| BAIAP2 | chr17 | 79089626 . . 79089626 | CCCT | C | NM_001144888 NM_006340 NM_017451 |
。 。 。 |
out-of-frame-codon-deletion 3-UTR intronic |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| COPB1 | 0.95 | 0.96 |
| XRCC5 | 0.95 | 0.94 |
| ARF4 | 0.95 | 0.95 |
| POLR2B | 0.94 | 0.93 |
| HSF2 | 0.94 | 0.94 |
| MATR3 | 0.94 | 0.93 |
| RFWD2 | 0.94 | 0.93 |
| CCT6A | 0.94 | 0.92 |
| PTBP2 | 0.94 | 0.93 |
| CSE1L | 0.94 | 0.93 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.75 | -0.88 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.88 |
| MT-CYB | -0.74 | -0.88 |
| AF347015.31 | -0.74 | -0.86 |
| AF347015.8 | -0.73 | -0.90 |
| AF347015.27 | -0.73 | -0.85 |
| AF347015.15 | -0.72 | -0.88 |
| HLA-F | -0.71 | -0.78 |
| AIFM3 | -0.71 | -0.78 |
| AF347015.26 | -0.70 | -0.88 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0008022 | 蛋白质糖基绑定 | 助教 | 10343108 | |
| 去:0008093 | 细胞骨架适配器活动 | 助教 | 10343108 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007409 | axonogenesis | 助教 | 神经元,轴突神经突(术语层面:12) | 10343108 |
| 去:0046847 | 外肉伪足的形成 | 国际能源机构 | 轴突(词级:10) | - - - - - - |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | 国际能源机构 | 神经突(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008286 | 胰岛素受体信号通路 | 助教 | 10343108 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0042995 | 细胞投影 | 国际能源机构 | 轴突(术语级别:4) | - - - - - - |
| 去:0005737 | 细胞质 | 助教 | 10343108 | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 助教 | 10343108 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ATN1 | B37 | D12S755E | DRPLA |点头 | atrophin 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10332026 |
| BAI1 | FLJ41988 | brain-specific血管生成抑制剂1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10343108 |
| C14orf1 | ERG28 | NET51 | 14号染色体开放阅读框1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| CDC42 | CDC42Hs | G25K | 细胞分裂周期42(三磷酸鸟苷结合蛋白,25 kda) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11696321 |
| DIAPH1 | DFNA1 | DIA1 | DRF1 | FLJ25265 | LFHL1 | hDIA1 | 精致的同族体1(果蝇) | - - - - - - | HPRD | 10814512 |
| ENAH | ENA | MENA | NDPP1 | 启用同族体(果蝇) | 重新组成复杂 | BioGRID | 11696321 |
| EPS8 | - - - - - - | 表皮生长因子受体通路衬底8 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15289329 |
| LIN7A | LIN-7A | LIN7 | MALS-1 | MGC148143 | TIP-33 | VELI1 | lin-7同族体(秀丽隐杆线虫) | - - - - - - | HPRD | 14596909 |
| LIN7B | LIN-7B | MALS-2 | MALS2 | VELI2 | lin-7同族体B(秀丽隐杆线虫) | - - - - - - | HPRD | 14596909 |
| NCKIPSD | 浸AF3P21 | | DIP1 | MGC23891 | ORF1 | SPIN90 | WASLBP |的愿望 | NCK SH3域相互作用的蛋白质 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| PAK1 | MGC130000 | MGC130001 | PAKalpha | p21蛋白(Cdc42 / Rac)活化激酶1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 11130076 |
| RAC1 | MGC111543 | MIG5 | TC-25 | p21-Rac1 | ras-related C3肉毒杆菌毒素基质1(ρ的家庭,小三磷酸鸟苷结合蛋白Rac1) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11130076|12054568 |
| SHANK1 | SPANK-1 | SSTRIP | synamon | SH3和多个锚蛋白重复域1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12504591 |
| SHANK2 | CORTBP1 | CTTNBP1 | ProSAP1 |柄| SPANK-3 | SH3和多个锚蛋白重复域2 | - - - - - - | HPRD | 12504591 |
| WASF1 | 波FLJ31482 | KIAA0269 | SCAR1 | | WAVE1 | 是蛋白质家族,成员1 | 西部 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 11130076 |
| WASF2 | SCAR2 | WAVE2 | dJ393P12.2 | 是蛋白质家族,成员2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11130076 |
| YWHAG | 14-3-3GAMMA | 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、伽马多肽 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG ADHERENS结 | 75年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG调节肌动蛋白细胞骨架 | 216年 | 144年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTAρ通路 | 32 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID CDC42通路 | 70年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID ERBB1下游通路 | 105年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID PDGFRB通路 | 129年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID RAC1通路 | 54 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SENESE HDAC1目标 | 260年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合DN | 329年 | 219年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标8小时 | 164年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHIARADONNA肿瘤转化CDC25 DN | 153年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE皮肤肿瘤促进剂 | 142年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE乳头状瘤风险低的DN | 165年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE乳头状瘤风险高的DN | 180年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE鳞状细胞癌 | 146年 | 104年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数 | 181年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TP53 SCIAN倒生的目标和TP73 DN | 31日 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移DN | 261年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王前列腺癌雄激素独立 | 66年 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌17 Q25对方篮里扩增子 | 335年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEI MYB目标 | 318年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 盖瑞CEBP目标 | 126年 | 90年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHIARETTI急性淋巴细胞白血病ZAP70 | 67年 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 克罗默转移DN | 81年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦克朗可卡因奖励5 d | 79年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN DELASERNA MYOD目标 | 57 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAZARD应对紫外线SCC DN | 123年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日胃癌化学敏感性 | 103年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 万利拉ZMPSTE24目标了 | 40 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BANDRES应对CARMUSTIN管理48小时DN | 161年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标被甲基化 | 461年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 欧阳前列腺癌进展DN | 21 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌生存非最优减积 | 510年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FLOTHO儿科所有治疗反应 | 29日 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 60张及目标的人力资源 | 293年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋化性DN | 457年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOSHIDA肝癌生存DN | 113年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WHITFIELD细胞周期G1 | 147年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FORTSCHEGGER PHF8目标 | 784年 | 464年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 促进DN KDM1A目标 | 211年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 149 | 338年 | 344年 | m8 | hsa - mir - 149大脑 | UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCC |
| mir - 181 | 1369年 | 1376年 | 1、m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
| hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
| hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
| miR-29 | 171年 | 177年 | m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| mir - 331 | 1345年 | 1352年 | 1、m8 | hsa - mir - 331大脑 | GCCCCUGGGCCUAUCCUAGAA |
| mir - 495 | 87年 | 93年 | m8 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |
| mir - 496 | 1405年 | 1411年 | 1 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |
| mir - 504 | 162年 | 168年 | m8 | hsa - mir - 504 | AGACCCUGGUCUGCACUCUAU |
| miR-9 | 791年 | 797年 | 1 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |