概括
基因 10461
象征 Mertk
同义词 mer | rp38 | tyro12 | c-eyk | c-mer
描述 MER原型癌基因,酪氨酸激酶
参考 MIM:604705|HGNC:HGNC:7027|Ensembl:ENSG00000153208|HPRD:05269|Vega:Otthumg00000131278
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q14.1
Pascal P值 0.019
Sherlock P值 0.596
胎儿β -1.658
主持人 尾状基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00755
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12490747 CHR3 9092889 Mertk 10461 0.03 反式
RS17061935 CHR6 101873751 Mertk 10461 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MBD3 0.81 0.80
USF2 0.77 0.75
STK11 0.73 0.71
NUBP2 0.73 0.73
DBNL 0.72 0.70
TSSC4 0.72 0.71
MRPS26 0.71 0.70
ZNF787 0.71 0.69
E4F1 0.71 0.66
C19orf52 0.71 0.65
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.49 -0.47
mt-cyb -0.46 -0.46
AF347015.33 -0.46 -0.44
AF347015.31 -0.45 -0.44
AF347015.8 -0.45 -0.45
AF347015.15 -0.45 -0.45
MT-CO2 -0.44 -0.42
AL139819.3 -0.44 -0.47
AF347015.21 -0.43 -0.44
MT-ATP8 -0.42 -0.47

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004714 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性 塔斯 神经突(GO期限:8) 8086340
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 塔斯 8086340
去:0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 8086340
去:0007166 细胞表面受体连接的信号转导 塔斯 8086340
去:0007601 视觉感知 IEA -
GO:0050896 对刺激的反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005625 可溶性部分 塔斯 8086340
去:0016020 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 8086340

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组细胞表面相互作用在血管壁 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王攀登目标 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移 44 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi对romidepsin的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 77 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化小脑DN 86 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21靶向DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老肌肉DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahajan对IL1A的回应 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戴维斯多发性骨髓瘤与MGUS DN 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园维甲酸的反应 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavazoie转移 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G6 UP 65 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO TH1细胞毒性模块 114 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟DN 99 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因