基因页面:ZNHIT1
总结吗?
GeneID | 10467年 |
象征 | ZNHIT1 |
同义词 | CG1I | ZNFN4A1 |
描述 | 锌指HIT-type包含1 |
参考 | HGNC: HGNC: 21688|运用:ENSG00000106400|HPRD: 15892|织女:OTTHUMG00000157113 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 7 q22.1 |
帕斯卡假定值 | 0.155 |
夏洛克假定值 | 0.767 |
胎儿β | -0.168 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg12625296 | 7 | 100861373 | ZNHIT1 | 6.09 e-8 | -0.013 | 1.53 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6958889 | chr7 | 100979309 | ZNHIT1 | 10467年 | 0.01 | 独联体 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNHIT1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
OTUD7A | 0.88 | 0.87 |
PNMAL2 | 0.85 | 0.81 |
TFE3 | 0.85 | 0.80 |
AC011484.2 | 0.85 | 0.81 |
BCL2L2 | 0.85 | 0.80 |
CBX6 | 0.85 | 0.82 |
TOM1L2 | 0.84 | 0.82 |
SNPH | 0.84 | 0.78 |
ZFYVE28 | 0.84 | 0.78 |
FAM120A | 0.83 | 0.82 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPL27 | -0.51 | -0.59 |
RPL35 | -0.50 | -0.58 |
RPS7 | -0.50 | -0.53 |
RPL32 | -0.49 | -0.57 |
PFDN5 | -0.49 | -0.52 |
RPS18 | -0.49 | -0.57 |
C9orf46 | -0.48 | -0.53 |
RPS10 | -0.48 | -0.54 |
RPL24 | -0.48 | -0.57 |
RPS13P2 | -0.48 | -0.55 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
金正日WT1 DN的目标 | 459年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应角化细胞 | 530年 | 342年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3滑落紫外线反应 | 309年 | 199年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王SMARCE1 DN的目标 | 371年 | 218年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN | 354年 | 216年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌DN | 540年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AGUIRRE胰腺癌拷贝数 | 298年 | 174年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陆EZH2的目标了 | 295年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG 36小时 | 29日 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |