基因页：PFDN6
概括？
| 基因 | 10471 |
| 象征 | PFDN6 |
| 同义词 | H2-KE2 | HKE2 | KE-2 | PFD6 |
| 描述 | preoldin亚基6 |
| 参考 | MIM：605660|HGNC：HGNC：4926|Ensembl：ENSG00000204220|HPRD：16135|Vega：Otthumg0000000031247 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.3 |
| Pascal P值 | 1.229E-5 |
| Sherlock P值 | 0.975 |
| 胎儿β | -0.738 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG03109443 | 6 | 33257607 | PFDN6 | 1.29e-8 | -0.019 | 5.17E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG10081998 | 6 | 33257756 | PFDN6 | 1.6e-8 | -0.013 | 5.95E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG13138329 | 6 | 33257788 | PFDN6 | 4.4e-8 | -0.015 | 1.21E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DNAJC16 | 0.93 | 0.94 |
| USP32 | 0.93 | 0.93 |
| VPS13D | 0.93 | 0.94 |
| ptprj | 0.92 | 0.94 |
| phlpp2 | 0.92 | 0.92 |
| plekhm3 | 0.91 | 0.93 |
| trappc10 | 0.91 | 0.94 |
| htt | 0.91 | 0.92 |
| SYT11 | 0.91 | 0.91 |
| ATG2B | 0.91 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C1orf61 | -0.55 | -0.66 |
| DBI | -0.54 | -0.60 |
| C1orf54 | -0.54 | -0.61 |
| AF347015.21 | -0.53 | -0.52 |
| GNG11 | -0.52 | -0.55 |
| Rhoc | -0.51 | -0.58 |
| C16orf74 | -0.50 | -0.54 |
| higd1b | -0.50 | -0.51 |
| Sycp3 | -0.50 | -0.55 |
| Rab34 | -0.49 | -0.55 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0051082 | 展开的蛋白质结合 | nas | 9630229 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006457 | 蛋白质折叠 | nas | 9630229 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0016272 | 前蛋白复合物 | nas | 9630229 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome preoldin介导的底物向CCT Tric的转移 | 28 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组蛋白折叠 | 53 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sotiriou乳腺癌1级vs 3 | 151 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 史密斯肝癌 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramaswamy转移 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对UV SCC的反应 | 123 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheok对胃嘌呤和高清MTX DN的反应 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-421 | 36 | 43 | 1A，M8 | HSA-MIR-421 | ggccucauaauguuguug |