概括
基因 10473
象征 HMGN4
同义词 HMG17L3 | NHC
描述 高迁移率组核小体结合结构域4
参考 HGNC:HGNC:4989|HPRD:17111|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 7.334e-10
Sherlock P值 0.236
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2403775 CHR8 133472361 HMGN4 10473 0.11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
尼尔 0.92 0.88
ZNF135 0.91 0.88
Qrich2 0.91 0.87
CCDC142 0.90 0.89
dot1l 0.90 0.90
DCHS1 0.90 0.87
AC145098.2 0.90 0.89
0.90 0.92
mical1 0.90 0.87
AD000671.1 0.90 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.65 -0.76
AIFM3 -0.64 -0.72
S100B -0.64 -0.79
aldoc -0.64 -0.69
COPZ2 -0.64 -0.78
AF347015.31 -0.64 -0.83
AF347015.27 -0.64 -0.83
HLA-F -0.63 -0.68
TSC22D4 -0.63 -0.73
FBXO2 -0.63 -0.65

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000785 染色质 IEA -
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU血管生成DN 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
田中甲基化食管癌中的甲基化 103 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ETS1和SP100 UP的Yordy倒数调节 25 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tomlins前列腺癌DN 40 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT网络 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标 148 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
用VH3 21 DN的FAELT B CLL 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老肌肉DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K9ME3 DN的Acevedo肝癌 120 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 56 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯托莫斯基对维生素D3 DN的反应 26 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因