概括
基因 10477
象征 ube2e3
同义词 UBCH9 | UBCM2
描述 泛素共轭酶E2 E3
参考 MIM:604151|HGNC:HGNC:12479|Ensembl:ENSG00000170035|HPRD:05000|Vega:Otthumg00000132585
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q32.1
Pascal P值 0.982
胎儿β 0.752
DMG 1(#研究)
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.1283

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24523758 2 181845005 ube2e3 2.34e-8 -0.019 7.73E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 14667819
去:0004842 泛素 - 蛋白连接酶活性 IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001558 细胞生长调节 IEA -
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
GO:0051246 蛋白质代谢过程的调节 IEA -
GO:0043687 翻译后蛋白质修饰 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG泛素介导的蛋白水解 138 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇3 28 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX8 PPARG融合的LUI目标 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN 81 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs供体DN 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肥胖症的纳德勒高血糖 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5靶向 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mody海马新生儿 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼的抵抗 81 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 46 52 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-139 344 350 1a HSA-MIR-139 ucuacagugcacgugucu
HSA-MIR-139 ucuacagugcacgugucu
mir-142-5p 61 67 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-143 503 510 1A,M8 HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-150 135 141 1a HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-205 23 29 1a HSA-MIR-205 uccuucauucccggagucug
mir-362 263 269 1a HSA-MIR-362 aauccuuggaaccuaggugugugugugugagu
mir-369-3p 291 297 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 291 297 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-377 20 26 1a HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-379 281 288 1A,M8 HSA-MIR-379 UgguagacuauggaaCGUA
mir-384 354 360 M8 HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-485-3p 323 330 1A,M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu