基因页:ube2e3
概括?
基因 | 10477 |
象征 | ube2e3 |
同义词 | UBCH9 | UBCM2 |
描述 | 泛素共轭酶E2 E3 |
参考 | MIM:604151|HGNC:HGNC:12479|Ensembl:ENSG00000170035|HPRD:05000|Vega:Otthumg00000132585 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q32.1 |
Pascal P值 | 0.982 |
胎儿β | 0.752 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.1283 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24523758 | 2 | 181845005 | ube2e3 | 2.34e-8 | -0.019 | 7.73E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UBE2E3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14667819 | |
去:0004842 | 泛素 - 蛋白连接酶活性 | IEA | - | |
GO:0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001558 | 细胞生长调节 | IEA | - | |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
GO:0051246 | 蛋白质代谢过程的调节 | IEA | - | |
GO:0043687 | 翻译后蛋白质修饰 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌簇3 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX8 PPARG融合的LUI目标 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN | 81 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs供体DN | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肥胖症的纳德勒高血糖 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5靶向 | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mody海马新生儿 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄达沙替尼的抵抗 | 81 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 | 76 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-128 | 46 | 52 | M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
mir-139 | 344 | 350 | 1a | HSA-MIR-139脑 | ucuacagugcacgugucu |
HSA-MIR-139脑 | ucuacagugcacgugucu | ||||
mir-142-5p | 61 | 67 | 1a | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
mir-143 | 503 | 510 | 1A,M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
mir-150 | 135 | 141 | 1a | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
mir-205 | 23 | 29 | 1a | HSA-MIR-205 | uccuucauucccggagucug |
mir-362 | 263 | 269 | 1a | HSA-MIR-362 | aauccuuggaaccuaggugugugugugugagu |
mir-369-3p | 291 | 297 | 1a | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-374 | 291 | 297 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
mir-377 | 20 | 26 | 1a | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
mir-379 | 281 | 288 | 1A,M8 | HSA-MIR-379脑 | UgguagacuauggaaCGUA |
mir-384 | 354 | 360 | M8 | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |
mir-485-3p | 323 | 330 | 1A,M8 | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |