概括
基因 10478
象征 SLC25A17
同义词 PMP34
描述 Solute Carrier家族25成员17
参考 MIM:606795|HGNC:HGNC:10987|ENSEMBL:ENSG00000100372|HPRD:08425|Vega:Otthumg00000151139
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.2
Pascal P值 2.405E-4
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG26548134 22 41185283 SLC25A17 2.71E-5 0.437 0.018 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
setDB1 0.93 0.93
TMEM57 0.92 0.94
hnrnpr 0.92 0.94
DHX29 0.92 0.94
CNOT2 0.92 0.93
RLF 0.92 0.94
mllt3 0.91 0.94
NCBP2 0.91 0.92
KDM4A 0.91 0.93
FDXACB1 0.91 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AIFM3 -0.77 -0.82
AF347015.31 -0.76 -0.88
FXYD1 -0.75 -0.89
TSC22D4 -0.74 -0.83
MT-CO2 -0.74 -0.87
AF347015.27 -0.74 -0.86
AF347015.33 -0.74 -0.86
aldoc -0.74 -0.75
HLA-F -0.73 -0.79
S100B -0.73 -0.82

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 10704444
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006839 线粒体运输 IEA 谷氨酸(GO期限:6) -
去:0006810 运输 塔斯 9874197
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005743 线粒体内膜 IEA -
去:0005777 过氧化物酶体 塔斯 9874197
去:0005778 过氧化物酶体膜 IEA -
去:0016020 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 9874197

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg过氧化物酶体 78 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组过氧化物酶体脂质代谢 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙血清敏感基因 90 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 73 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因