基因页:SLC25A17
概括?
基因 | 10478 |
象征 | SLC25A17 |
同义词 | PMP34 |
描述 | Solute Carrier家族25成员17 |
参考 | MIM:606795|HGNC:HGNC:10987|ENSEMBL:ENSG00000100372|HPRD:08425|Vega:Otthumg00000151139 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.2 |
Pascal P值 | 2.405E-4 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG26548134 | 22 | 41185283 | SLC25A17 | 2.71E-5 | 0.437 | 0.018 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
setDB1 | 0.93 | 0.93 |
TMEM57 | 0.92 | 0.94 |
hnrnpr | 0.92 | 0.94 |
DHX29 | 0.92 | 0.94 |
CNOT2 | 0.92 | 0.93 |
RLF | 0.92 | 0.94 |
mllt3 | 0.91 | 0.94 |
NCBP2 | 0.91 | 0.92 |
KDM4A | 0.91 | 0.93 |
FDXACB1 | 0.91 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AIFM3 | -0.77 | -0.82 |
AF347015.31 | -0.76 | -0.88 |
FXYD1 | -0.75 | -0.89 |
TSC22D4 | -0.74 | -0.83 |
MT-CO2 | -0.74 | -0.87 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.86 |
AF347015.33 | -0.74 | -0.86 |
aldoc | -0.74 | -0.75 |
HLA-F | -0.73 | -0.79 |
S100B | -0.73 | -0.82 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10704444 | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006839 | 线粒体运输 | IEA | 谷氨酸(GO期限:6) | - |
去:0006810 | 运输 | 塔斯 | 9874197 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
去:0005743 | 线粒体内膜 | IEA | - | |
去:0005777 | 过氧化物酶体 | 塔斯 | 9874197 | |
去:0005778 | 过氧化物酶体膜 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9874197 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg过氧化物酶体 | 78 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组过氧化物酶体脂质代谢 | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙血清敏感基因 | 90 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 | 73 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |