基因页：HOXB13
概括？
| 基因 | 10481 |
| 象征 | HOXB13 |
| 同义词 | PSGD |
| 描述 | Homeobox B13 |
| 参考 | MIM：604607|HGNC：HGNC：5112|ENSEMBL：ENSG00000159184|HPRD：05210|Vega：Otthumg00000159900 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q21.2 |
| Pascal P值 | 0.076 |
| 胎儿β | -1.395 |
| DMG | 2（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21842478 | 17 | 46806046 | HOXB13 | 1.2E-6 | -0.392 | 0.007 | DMG：Wockner_2014 |
| CG18479972 | 17 | 46810705 | HOXB13 | 8.4e-8 | -0.012 | 1.95E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GNA13 | 0.85 | 0.83 |
| DOCK7 | 0.83 | 0.79 |
| C2orf67 | 0.82 | 0.79 |
| Smad4 | 0.82 | 0.76 |
| CTPS2 | 0.82 | 0.81 |
| PDCL | 0.81 | 0.77 |
| hnrnpf | 0.81 | 0.80 |
| CPNE3 | 0.81 | 0.81 |
| Smurf2 | 0.81 | 0.81 |
| ZNF160 | 0.81 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.56 | -0.60 |
| CA4 | -0.55 | -0.61 |
| ifi27 | -0.55 | -0.65 |
| CXCL14 | -0.54 | -0.65 |
| asphd1 | -0.53 | -0.54 |
| Arhgdig | -0.53 | -0.64 |
| MT-CO2 | -0.53 | -0.62 |
| DBP | -0.53 | -0.57 |
| SLC9A3R2 | -0.52 | -0.46 |
| AF347015.31 | -0.52 | -0.61 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID AR TF途径 | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIZ红细胞分化HBZ | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlesinger甲基化的癌症 | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova在APL中甲基化 | 68 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西部肾上腺皮质癌与腺瘤 | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 | 126 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 137 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K27ME3 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |