基因页：CRTAP
概括？
| 基因 | 10491 |
| 象征 | CRTAP |
| 同义词 | CASP | Leprel3 | OI7 | P3H5 |
| 描述 | 软骨相关蛋白 |
| 参考 | MIM：605497|HGNC：HGNC：2379|ENSEMBL：ENSG00000170275|HPRD：16110|Vega：Otthumg00000130746 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P22.3 |
| Pascal P值 | 0.12 |
| 胎儿β | -0.27 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG04397936 | 3 | 33155330 | CRTAP | 5.37e-12 | -0.012 | 1.78E-7 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| pxmp3 | 0.71 | 0.66 |
| 猪 | 0.71 | 0.56 |
| TMEM126A | 0.71 | 0.66 |
| CGRRF1 | 0.70 | 0.63 |
| C18orf32 | 0.70 | 0.57 |
| TMEM14C | 0.70 | 0.57 |
| CMC1 | 0.70 | 0.66 |
| GSTO1 | 0.70 | 0.69 |
| NDUFB1 | 0.69 | 0.55 |
| ATP5G3 | 0.69 | 0.52 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| tnks1bp1 | -0.53 | -0.57 |
| hip1r | -0.51 | -0.59 |
| SAFB2 | -0.50 | -0.51 |
| gigyf2 | -0.50 | -0.50 |
| ZC3H13 | -0.49 | -0.51 |
| LRP1 | -0.49 | -0.52 |
| USP36 | -0.49 | -0.52 |
| PHLDB1 | -0.49 | -0.55 |
| SUPT6H | -0.49 | -0.49 |
| MAP4K4 | -0.49 | -0.56 |
第三节。基因本体论注释
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0005578 | 蛋白质细胞外基质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome细胞外基质组织 | 87 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胶原蛋白形成 | 58 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冷吉非替尼抵抗 | 85 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chiaradonna肿瘤转化Kras DN | 142 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yanagihara ESX1目标 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEI mir34a目标 | 148 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iglesias E2F目标 | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽玛辐射2G后的生存率不佳 | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhati G2M被2methoxyestradiol DN逮捕 | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 尼尔森·吉斯特（Nielsen Gist） | 98 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanloo SP3靶向DN | 89 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| boudoukha由IGF2BP2绑定 | 111 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| Let-7/98 | 83 | 89 | 1a | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
| HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
| HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
| HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
| HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
| HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
| HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
| HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
| HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
| mir-331 | 4776 | 4782 | M8 | HSA-MIR-331脑 | gccccugggccuauccuagaa |
| mir-335 | 4600 | 4606 | 1a | HSA-MIR-335脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU |