基因页：VAT1
概括？
| 基因 | 10493 |
| 象征 | VAT1 |
| 同义词 | 瓦蒂 |
| 描述 | 囊泡胺传输1 |
| 参考 | MIM：604631|HGNC：HGNC：16919|ENSEMBL：ENSG00000108828|HPRD：05220|Vega：Otthumg00000180816 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17Q21 |
| Pascal P值 | 0.019 |
| Sherlock P值 | 0.159 |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1836711 | CHR2 | 237848642 | VAT1 | 10493 | 0.15 | 反式 | ||
| RS6822565 | CHR4 | 148437511 | VAT1 | 10493 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SMEK2 | 0.97 | 0.97 |
| IPO7 | 0.96 | 0.97 |
| CAND1 | 0.96 | 0.97 |
| ABCE1 | 0.96 | 0.96 |
| FYTTD1 | 0.95 | 0.96 |
| NCBP1 | 0.95 | 0.96 |
| ube3a | 0.95 | 0.96 |
| BZW1 | 0.95 | 0.95 |
| KIAA1430 | 0.95 | 0.96 |
| MATR3 | 0.95 | 0.95 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.71 | -0.85 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.83 |
| ifi27 | -0.69 | -0.83 |
| AF347015.31 | -0.69 | -0.81 |
| AC018755.7 | -0.68 | -0.75 |
| AF347015.33 | -0.68 | -0.80 |
| higd1b | -0.67 | -0.82 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.79 |
| AF347015.8 | -0.67 | -0.81 |
| HLA-F | -0.66 | -0.73 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Barretts食道和食道癌DN | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML复发预后 | 35 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| der ifn伽马响应 | 71 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中岛肥大细胞 | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 糖尿病性肾病 | 86 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kayo卡路里限制肌肉 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab失败心室DN | 41 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 公园APL发病机理DN | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时 | 61 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Demagalhaes老化 | 55 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |