概括
基因 10497
象征 UNC13B
同义词 munc13 | unc13 | unc13h2
描述 UNC-13同源物B(秀丽隐杆线虫)
参考 MIM:605836|HGNC:HGNC:12566|ENSEMBL:ENSG00000198722|HPRD:05785|Vega:Otthumg0000000019856
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9p13.3
Pascal P值 0.007
Sherlock P值 0.709
胎儿β 0.146
支持 canabinoid
胞吞作用
代谢性谷氨酸受体
5-羟色胺
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZFP62 0.93 0.78
TET1 0.92 0.81
EPB41 0.92 0.75
Smarcc1 0.91 0.82
IGF2BP3 0.91 0.85
CCDC123 0.91 0.86
FUBP1 0.91 0.80
CASP2 0.91 0.80
LRIG2 0.91 0.74
不,不 0.91 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO2 -0.68 -0.76
C5orf53 -0.67 -0.81
LHPP -0.67 -0.65
HLA-F -0.67 -0.74
TNFSF12 -0.66 -0.71
aldoc -0.66 -0.74
LDHD -0.66 -0.72
pth1r -0.66 -0.68
AIFM3 -0.65 -0.71
SLC16A11 -0.65 -0.67

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 塔斯 9607201
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0019992 二酰基甘油结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007268 突触传输 IEA 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) -
GO:0016082 突触囊泡启动 IEA 突触(GO期限:10) -
去:0007242 细胞内信号传导级联 IEA -
去:0006917 诱导凋亡 塔斯 10233166
去:0007588 排泄 塔斯 9607201
去:0006887 胞吞作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
去:0005794 高尔基体 塔斯 9607201
去:0005737 细胞质 塔斯 10233166
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
反应组谷氨酸神经递质释放周期 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经递质释放周期 34 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heidenblad Amplicon 8Q24 UP 40 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1本地化的Alcalay AML 140 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-151 860 867 1A,M8 HSA-MIR-151 Acuagacugaagcucuugagg
mir-183 1249 1255 M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug