基因页:UNC13B
概括?
基因 | 10497 |
象征 | UNC13B |
同义词 | munc13 | unc13 | unc13h2 |
描述 | UNC-13同源物B(秀丽隐杆线虫) |
参考 | MIM:605836|HGNC:HGNC:12566|ENSEMBL:ENSG00000198722|HPRD:05785|Vega:Otthumg0000000019856 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p13.3 |
Pascal P值 | 0.007 |
Sherlock P值 | 0.709 |
胎儿β | 0.146 |
支持 | canabinoid 胞吞作用 代谢性谷氨酸受体 5-羟色胺 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UNC13B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZFP62 | 0.93 | 0.78 |
TET1 | 0.92 | 0.81 |
EPB41 | 0.92 | 0.75 |
Smarcc1 | 0.91 | 0.82 |
IGF2BP3 | 0.91 | 0.85 |
CCDC123 | 0.91 | 0.86 |
FUBP1 | 0.91 | 0.80 |
CASP2 | 0.91 | 0.80 |
LRIG2 | 0.91 | 0.74 |
不,不 | 0.91 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXO2 | -0.68 | -0.76 |
C5orf53 | -0.67 | -0.81 |
LHPP | -0.67 | -0.65 |
HLA-F | -0.67 | -0.74 |
TNFSF12 | -0.66 | -0.71 |
aldoc | -0.66 | -0.74 |
LDHD | -0.66 | -0.72 |
pth1r | -0.66 | -0.68 |
AIFM3 | -0.65 | -0.71 |
SLC16A11 | -0.65 | -0.67 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体活性 | 塔斯 | 9607201 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0019992 | 二酰基甘油结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007268 | 突触传输 | IEA | 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) | - |
GO:0016082 | 突触囊泡启动 | IEA | 突触(GO期限:10) | - |
去:0007242 | 细胞内信号传导级联 | IEA | - | |
去:0006917 | 诱导凋亡 | 塔斯 | 10233166 | |
去:0007588 | 排泄 | 塔斯 | 9607201 | |
去:0006887 | 胞吞作用 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
去:0005794 | 高尔基体 | 塔斯 | 9607201 | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 10233166 | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
反应组谷氨酸神经递质释放周期 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经递质释放周期 | 34 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heidenblad Amplicon 8Q24 UP | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森对雄激素的反应 | 86 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc E2F1 UP | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1本地化的Alcalay AML | 140 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时 | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向 | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A4 | 196 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-151 | 860 | 867 | 1A,M8 | HSA-MIR-151脑 | Acuagacugaagcucuugagg |
mir-183 | 1249 | 1255 | M8 | HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug |