概括?
基因ID 1052
Symbol CEBPD
同义词 C/EBP-delta|CELF|CRP3|NF-IL6-beta
描述 CCAAT/增强子结合蛋白三角洲
参考 MIM:116898|HGNC:HGNC:1835|HPRD:00297|
基因type protein-coding
地图位置 8p11.2-p11.1
Pascal P值 0.237
Sherlock P值 0.899
Fetal beta -1.768
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Nishioka_2013 Genome-wide DNA methylation analysis The authors investigated the methylation profiles of DNA in peripheral blood cells from 18 patients with first-episode schizophrenia (FESZ) and from 15 normal controls. 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统本身arch in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta(dis) FDR (dis) Study
cg06734962 8 48650989 CEBPD -0.023 0.3 DMG:Nishioka_2013


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
ZNF787 0.68 0.65
USF2 0.66 0.62
MBD3 0.65 0.59
Rabep2 0.64 0.64
MAD1L1 0.63 0.58
ADAT3 0.63 0.62
SCRIB 0.63 0.67
LZTS2 0.62 0.59
ZNF784 0.62 0.62
ZNF579 0.62 0.61
前10个负共表达基因
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
PIGB -0.50 -0.48
KMO -0.47 -0.48
PLA2G4A -0.47 -0.50
LY96 -0.47 -0.46
ACOT13 -0.46 -0.45
LPAR6 -0.44 -0.45
TPMT -0.44 -0.44
CGRRF1 -0.43 -0.45
ITM2B -0.43 -0.45
GLMN -0.42 -0.44

V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
PID HNF3B PATHWAY 45 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL6 7 PATHWAY 47 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB PATHWAY 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID DELTA NP63 PATHWAY 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid myc抑制道路 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RB 1 Pathway 65 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSCRIPTIONAL REGULATION OF WHITE ADIPOCYTE DIFFERENTIATION 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE DN 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA UP 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CORRE MULTIPLE MYELOMA DN 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA DN 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI APL SECONDARY VS DE NOVO UP 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE BREAST CANCER CLASSES DN 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS UP 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAL LEUKEMIC STEM CELL DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEPPER CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIA UP 33 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE NEURAL CREST STEM CELL UP 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 2HR DN 88 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 6HR DN 167 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Naderi乳腺癌预后DN 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS F UP 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI THYROID CANCER CLUSTER 1 51 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAUER STAT3 TARGETS UP 49 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
korkola蛋黄囊肿瘤 62 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAI RESISTANCE TO NEOPLASTIC TRANSFROMATION 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYC AMPLIFICATION TARGETS DN 97 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLESINGER METHYLATED DE NOVO IN CANCER 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOTTON RUNX TARGETS DN 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR UP 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SUZ12 TARGETS 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSS AML WITH CBFB MYH11 FUSION 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMITH TERT TARGETS UP 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OKUMURA INFLAMMATORY RESPONSE LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn伽马响应 71 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEMETH INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA MF UP 47 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSE HYPOXIA UP 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD T LYMPHOCYTE AND NK PROGENITOR DN 63 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA DN 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAMALHO STEMNESS DN 74 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG RESPONSE TO ARSENITE DN 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 8HR DN 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS DN 64 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 8 HR DN 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takao对UVB辐射DN的响应 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D7 40 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG阿霉素抗性DN 19 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 2HR 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 1 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD RESPONSE TO UV NHEK DN 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHENG RESPONSE TO NICKEL ACETATE 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD UV RESPONSE CLUSTER G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C7 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 9 92 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 common 77 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WALLACE PROSTATE CANCER RACE UP 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HANN RESISTANCE TO BCL2 INHIBITOR DN 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE WNT3A TARGETS UP 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF DN 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 DN 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEDDEN肺癌好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML CLUSTER 3 33 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信号24小时 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 0 76 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村掺杂早期 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA ADIPOGENESIS LATE UP 104 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD RESPONSE TO TZD DN 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUBTIL PROGESTIN TARGETS 36 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF TARGETS UP 63 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 PARTIAL 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上 146 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION 128 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因