Summary?
基因ID 10524
Symbol Kat5
同义词 ESA1|HTATIP|HTATIP1|PLIP|TIP|TIP60|ZC2HC5|cPLA2
描述 lysine acetyltransferase 5
参考 MIM:601409|HGNC:HGNC:5275|ENSEMBL:ENSG00000172977|HPRD:03245|Vega:Otthumg00000166617
基因type protein-coding
地图位置 11q13
Pascal P值 0.006
度p-value DEG:Maycox_2009:cc_ba10_fold_change = -1.05:cc_ba10_disease_p = 0.0415:hbb_ba9_fold_change = -1.12:hbb_ba9_disease_p = 0.0352
Fetal beta 0.164
支持 染色质重塑基因

基因数据来源
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
度:Maycox_2009 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 We included 51 genes whose expression changes are common between two schizophrenia cohorts.
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.8537

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
VBP1 0.89 0.87
PSMD10 0.86 0.86
PSMD14 0.86 0.85
FH 0.86 0.84
GTF2B 0.85 0.85
TCEAL8 0.85 0.82
是的 0.85 0.85
eapp 0.85 0.86
DRG1 0.85 0.84
MORF4L1 0.85 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.61 -0.57
AF347015.8 -0.60 -0.56
AF347015.2 -0.60 -0.60
AF347015.26 -0.59 -0.59
AF347015.33 -0.59 -0.57
MT-CYB -0.58 -0.56
TINAGL1 -0.58 -0.62
ifi27 -0.57 -0.62
USHBP1 -0.57 -0.62
AF347015.15 -0.57 -0.57

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0003682 染色质binding IEA -
去:0003713 transcription coactivator activity NAS 15572661
GO:0005515 protein binding IPI 15383276|16169070|17110330
GO:0004402 histone acetyltransferase activity IEA -
GO:0016740 transferase activity IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0008415 acyltransferase activity IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
GO:0050681 雄激素受体结合 NAS 15572661
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0001558 regulation of cell growth IEA -
GO:0006302 double-strand break repair 小鬼 10966108
GO:0006333 染色质组装或拆卸 IEA -
GO:0006350 transcription IEA -
GO:0006366 transcription from RNA polymerase II promoter 塔斯 8607265
GO:0016568 染色质修饰 IEA -
GO:0016573 histone acetylation 艾达 10966108
GO:0030521 androgen receptor signaling pathway NAS 15572661
GO:0045893 positive regulation of transcription, DNA-dependent NAS 15572661
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000785 染色质 IEA -
GO:0005634 塔斯 8607265
GO:0005737 细胞质 IEA -
GO:0035267 NuA4 histone acetyltransferase complex 艾达 10966108

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ACTL6A actl6 |arp4 |BAF53A |INO80K |MGC5382 actin-like 6A Co-fractionation BioGRID 11839798
APBB1 FE65 |MGC:9072 |里尔 amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 (Fe65) - HPRD 12888553
APP AAA | ABETA | ABPP | AD1 | APPI | CTFgamma | CVAP | PN2 amyloid beta (A4) precursor protein - HPRD 12888553
AR AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM androgen receptor Biochemical Activity
2台混合动力
BioGRID 11994312
AR AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM androgen receptor - HPRD 10364196
Arih2 ARI2 | FLJ10938 | FLJ33921 | TRIAD1 Ariadne同源2(果蝇) 2台混合动力 BioGRID 16169070
BCL3 bcl4 |D19S37 B-cell CLL/lymphoma 3 - HPRD,Biogrid 10362352
BCL3 bcl4 |D19S37 B-cell CLL/lymphoma 3 HTATIP (Tip60) interacts with BCL3. BIND 15829968
BMI1 MGC12685 |PCGF4 |RNF51 BMI1polycomb ring finger oncogene 2台混合动力 BioGRID 16169070
C1orf174 RP13-531C17.2 chromosome 1 open reading frame 174 2台混合动力 BioGRID 16169070
C20ORF20 Eaf7 | FLJ10914 | MRG15BP | MRGBP | URCC4 染色体20开放阅读框20 - HPRD 12963728
C7orf20 CEE | CGI-20 染色体7开放阅读框20 2台混合动力 BioGRID 16169070
CBX8 HPC3 |PC3 |RC1 Chromobox同源物8(PC类同源物,果蝇) 2台混合动力 BioGRID 16169070
CCDC106 HSU79303 |ZNF581 包含106 2台混合动力 BioGRID 16169070
CCT7 CCT-ETA | Ccth | MGC110985 | Nip7-1 | TCP-1-eta chaperonin containing TCP1, subunit 7 (eta) 2台混合动力 BioGRID 16169070
CD82 4f9 |C33 |Gr15 |IA4 |kai1 |R2 |SAR2 |ST6 |TSPAN27 CD82molecule HTATIP(TIP60)与CD82(KAI1)启动子相互作用。 BIND 15829968
CDC42 cdc42hs |G25K 细胞分裂周期42(GTP结合蛋白,25KDA) 2台混合动力 BioGRID 16169070
CDK5RAP2 C48 | Cep215 | DKFZp686B1070 | DKFZp686D1070 | KIAA1633 | MCPH3 CDK5调节亚基相关蛋白2 2台混合动力 BioGRID 16169070
CREB1 Creb |MGC9284 cAMP responsive element binding protein 1 - HPRD,Biogrid 10720489
Creld1 AVSD2 |Cirrin |DKFZP566D213 具有EGF样域1的半胱氨酸富含半胱氨酸 2台混合动力 BioGRID 16169070
CSTF2 CSTF-64 cleavage stimulation factor, 3' pre-RNA, subunit 2, 64kDa 2台混合动力 BioGRID 16169070
DLEU1 BCMS |DLB1 |dleu2 |leu1 |Leu2 |MGC22430 |NCRNA00021 |XTP6 在淋巴细胞性白血病1(非蛋白质编码)中删除 2台混合动力 BioGRID 16169070
埃德拉 ETA | ETRA 内皮素受体A型 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
2台混合动力
BioGRID 11262386
EFNA1 B61 |Ecklg |efl1 |eplg1 |lerk1 |TNFAIP4 ephrin-A1 2台混合动力 BioGRID 16169070
EP400 CAGH32 | DKFZP434I225 | FLJ42018 | FLJ45115 | P400 | TNRC12 E1A binding protein p400 Affinity Capture-Western BioGRID 11509179
ETV6 电话|电话/abl ETS变体6 - HPRD,Biogrid 12737628
FAM101B MGC45871 family with sequence similarity 101, member B 2台混合动力 BioGRID 16169070
FAM135B C8ORFK32 | MGC126009 | MGC126010 | MGC33221 具有序列相似性的家庭135,成员b 2台混合动力 BioGRID 16169070
FAM173A C16orf24 |MGC2494 具有序列相似性的家庭173,成员a 2台混合动力 BioGRID 16169070
fas ALPS1A | APO-1 | APT1 | CD95 | FAS1 | FASTM | TNFRSF6 FAS(TNF受体超家族,成员6) HTATIP(TIP60)与FAS启动子相互作用。 BIND 15829968
双子座7 SIP3 宝石(核管细胞器)相关蛋白7 2台混合动力 BioGRID 16169070
grin1 NMDA1 |NMDAR1 |NR1 glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 1 - HPRD 10862698
GSTO1 DKFZp686H13163 | GSTTLp28 | P28 谷胱甘肽S-转移酶欧米茄1 2台混合动力 BioGRID 16169070
HDAC1 DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 - HPRD 11994312
HDAC7 DKFZp586J0917 | FLJ99588 | HD7A | HDAC7A 组蛋白脱乙酰基酶7 Affinity Capture-Western
2台混合动力
BioGRID 12551922
hnrnph3 2H9 |FLJ34092 |HNRPH3 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 (2H9) 2台混合动力 BioGRID 16169070
IK CSA2 |MGC59741 |红色的 IK Cytokine,HLA II的下调剂 2台混合动力 BioGRID 16169070
Kat5 esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 K(lysine) acetyltransferase 5 Affinity Capture-Western BioGRID 11416127
KLK3 APS |KLK2A1 |PSA |HK3 Kallikrein相关肽酶3 HTATIP (Tip60) interacts with the KLK3 (PSA) promoter. BIND 15829968
LMNA cdcd1 |CDDC |cmd1a |CMT2B1 |emd2 |fpl |fpld |HGPS |IDC |LDP1 | LFP | LGMD1B | LMN1 | LMNC | PRO1 lamin A/C 2台混合动力 BioGRID 16169070
LRP1 A2MR | APOER | APR | CD91 | FLJ16451 | IGFBP3R | LRP | MGC88725 | TGFBR5 低密度脂蛋白相关蛋白1(Alpha-2-巨球蛋白受体) - HPRD,Biogrid 12888553
MAD2L1BP CMT2 | KIAA0110 | MGC11282 | RP1-261G23.6 MAD2L1结合蛋白 2台混合动力 BioGRID 16169070
MDM2 HDMX |MGC71221 |HDM2 MDM2 p53结合蛋白同源物(小鼠) - HPRD,Biogrid 11927554
MYC bHLHe39 | c-Myc v-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog (avian) - HPRD,Biogrid 12776177
NAP1L5 DRLM nucleosome assembly protein 1-like 5 2台混合动力 BioGRID 16169070
NDUFA4L2 FLJ26118 | NUOMS NADH脱氢酶(泛氨基酮)1α子复杂,4类样2 2台混合动力 BioGRID 16169070
NDUFV2 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 2, 24kDa 2台混合动力 BioGRID 16169070
NFKB1 DKFZp686C01211 | EBP-1 | KBF1 | MGC54151 | NF-kappa-B | NFKB-p105 | NFKB-p50 | p105 nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 HTATIP (Tip60) interacts with NFKB1 (p50). BIND 15829968
OGFOD2 DKFZp686H15154 | FLJ13491 | FLJ37501 | MGC120434 | MGC120436 2-氧气谷物和铁依赖性氧酶结构域,含有2个 2台混合动力 BioGRID 16169070
PDCD5 MGC9294 |TFAR19 programmed cell death 5 2台混合动力 BioGRID 16169070
PLA2G4A MGC126350 |pla2g4 |cpla2-alpha 磷脂酶A2,IVA组(胞质,钙依赖性) - HPRD,Biogrid 11416127
Plekha4 PEPP1 pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 4 2台混合动力 BioGRID 16169070
POLE2 DPE2 聚合酶(指向DNA),Epsilon 2(P59亚基) 2台混合动力 BioGRID 16169070
POLR3F MGC13517 |RPC39 |RPC6 聚合酶(RNA)III(定向DNA)多肽F,39 kDa 2台混合动力 BioGRID 16169070
PTPN4 PTPMEG | PTPMEG1 蛋白质酪氨酸磷酸酶,non-receptor类型4(megakaryocyte) 2台混合动力 BioGRID 16169070
PTPR PTPSIGMA protein tyrosine phosphatase, receptor type, S 2台混合动力 BioGRID 16169070
RGL2 HKE1.5 |ke1.5 |rab2l 拉尔鸟嘌呤核苷酸解离刺激器样2 2台混合动力 BioGRID 16169070
RUVBL1 ECP54 | INO80H | NMP238 | PONTIN | Pontin52 | RVB1 | TIH1 | TIP49 | TIP49A ruvb样1(大肠杆菌) HTATIP(TIP60)与RUVBL1(Pontin)相互作用。 BIND 15829968
SAT1 DC21 | KFSD | SAT | SSAT | SSAT-1 spermidine/spermine N1-acetyltransferase 1 2台混合动力 BioGRID 16169070
SNAPIN 快照 SNAP-associated protein 2台混合动力 BioGRID 16169070
SNRPD2 SMD2 | SNRPD1 small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide 16.5kDa 2台混合动力 BioGRID 16169070
STAT3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 signal transducer and activator of transcription 3 (acute-phase response factor) - HPRD,Biogrid 12551922
SYN1 SYN1a | SYN1b | SYNI synapsin I 2台混合动力 BioGRID 16169070
部落3 C20orf97 |nipk |水槽|Skip3 |TRB3 tribbles homolog 3 (Drosophila) 2台混合动力 BioGRID 16169070
ZEB1 areb6 |BZP |delta-ef1 |MGC133261 |nil-2-a |nil-2a |nil2a |TCF8 |Zeb |ZFHEP | ZFHX1A zinc finger E-box binding homeobox 1 - HPRD,Biogrid 11275565
ZNF24 KOX17 | RSG-A | ZNF191 | ZSCAN3 | Zfp191 zinc finger protein 24 2台混合动力 BioGRID 16169070


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
ST ERK1 ERK2 MAPK PATHWAY 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St Myocyte广告路径 27 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P73Pathway 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC活动途径 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATM PATHWAY 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC PATHWAY 25 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR TF PATHWAY 53 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATF2途径 59 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53 REGULATION PATHWAY 59 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁与HDAC互动 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC增强的Schlosser血清反应 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN UP 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND UP 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAYO CALORIE RESTRICTION MUSCLE DN 87 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANDRAN METASTASIS DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因