Summary
基因ID 10525
象征 Hyou1
同义词 GRP-170 | GRP170 | HSP12A | ORP-150 | ORP150
描述 缺氧上调1
参考 MIM:601746|HGNC: HGNC: 16931|ENSEMBL:ENSG00000149428|HPRD:03448|Vega:Otthumg00000166354
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11Q23.1-Q23.3
Pascal P值 0.007
Sherlock P值 0.576
胎儿β -1.349
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因数据来源
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
cg02213487 11 118928076 Hyou1 1.744E-4 -0.274 0.033 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4964680 CHR12 108739516 Hyou1 10525 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TNPO1 0.95 0.93
Stag1 0.95 0.91
CCDC50 0.95 0.90
PHF16 0.95 0.90
PDCL 0.94 0.88
ZNF28 0.94 0.89
AP3M1 0.94 0.88
Smad4 0.94 0.89
PAK2 0.93 0.91
GNAI3 0.93 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.62 -0.67
ifi27 -0.60 -0.78
AC018755.7 -0.60 -0.66
MT-CO2 -0.60 -0.76
pth1r -0.60 -0.67
CA4 -0.60 -0.69
HLA-F -0.60 -0.66
FXYD1 -0.60 -0.75
AF347015.31 -0.59 -0.74
AF347015.27 -0.59 -0.72

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去:0005524 ATP结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006950 对压力的反应 塔斯 9020069
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005788 内质网腔 IEA -
去:0005783 内质网 塔斯 9020069

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATION OF CHAPERONE GENES BY XBP1S 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petretto心脏质量QTL顺式DN 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL融合一起 87 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
耀西MURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向DN 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikhaylova通过VHL向上氧化应激反应 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
朱凯尔的目标 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 128 937 943 1a hsa-miR-128a ucacagugaaccggucuuuu
hsa-miR-128b ucacagugaaccggucuuc
mir-181 985 992 1A,M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-186 1394 1400 M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-27 937 943 M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
miR-494 1380 1386 1a HSA-MIR-494 ugaaacauacgggaaaccucuu