基因页：PITRM1
概括？
| 基因 | 10531 |
| 象征 | PITRM1 |
| 同义词 | MP1 |准备 |
| 描述 | pitrilysin金属肽酶1 |
| 参考 | HGNC：HGNC：17663|Ensembl：ENSG00000107959|HPRD：07142|Vega：Otthumg0000000017557 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 10p15.2 |
| Pascal P值 | 0.416 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| DNM：Guipponi_2014 | 整个外显子组测序分析 | 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PITRM1 | 一个 | G | NM_001242309 | p.k710r | 错过 | 0.46 | 0.48 | 精神分裂症 | DNM：Guipponi_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG19952014 | 10 | 3186114 | PITRM1 | 4.084e-4 | 0.628 | 0.044 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7086721 | 10 | 3163068 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.158E-7 | 0 | 51935 | gtex_brain_ba24 |
| RS139615043 | 10 | 3183044 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 9.413E-9 | 0 | 31959 | gtex_brain_ba24 |
| RS76088740 | 10 | 3193412 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 9.64e-9 | 0 | 21591 | gtex_brain_ba24 |
| RS4881121 | 10 | 3220372 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 8.685e-7 | 0 | -5369 | gtex_brain_ba24 |
| RS4881122 | 10 | 3220859 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 7.613E-7 | 0 | -5856 | gtex_brain_ba24 |
| RS9423511 | 10 | 3220978 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 8.702E-7 | 0 | -5975 | gtex_brain_ba24 |
| RS7911657 | 10 | 3161729 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 5.958e-7 | 0 | 53274 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7898894 | 10 | 3161744 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.144e-7 | 0 | 53259 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61340420 | 10 | 3161797 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 5.756e-7 | 0 | 53206 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6602026 | 10 | 3162423 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 3.403E-7 | 0 | 52580 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7086721 | 10 | 3163068 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.224e-8 | 0 | 51935 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9423684 | 10 | 3163512 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 3.403E-7 | 0 | 51491 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7913100 | 10 | 3164194 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 3.403E-7 | 0 | 50809 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6602029 | 10 | 3164892 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 8.525e-7 | 0 | 50111 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3816703 | 10 | 3167465 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 8.155e-7 | 0 | 47538 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6602031 | 10 | 3167983 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 6.757E-7 | 0 | 47020 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4881100 | 10 | 3169045 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 6.757E-7 | 0 | 45958 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4584487 | 10 | 3170256 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 6.151E-7 | 0 | 44747 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2279205 | 10 | 3170919 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 6.757E-7 | 0 | 44084 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4611105 | 10 | 3173364 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 8.078e-7 | 0 | 41639 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9423487 | 10 | 3175088 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 6.994E-7 | 0 | 39915 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3740612 | 10 | 3175763 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 6.995E-7 | 0 | 39240 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS2306312 | 10 | 3176456 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 6.995E-7 | 0 | 38547 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3814599 | 10 | 3216153 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.242E-7 | 0 | -1150 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9423505 | 10 | 3218264 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.073E-7 | 0 | -3261 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9423506 | 10 | 3218457 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.073E-7 | 0 | -3454 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4881120 | 10 | 3219399 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.075E-7 | 0 | -4396 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6602036 | 10 | 3219794 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.076E-7 | 0 | -4791 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4881121 | 10 | 3220372 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.078E-7 | 0 | -5369 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4881122 | 10 | 3220859 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.789E-7 | 0 | -5856 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9423511 | 10 | 3220978 | PITRM1 | ENSG00000107959.11 | 1.08e-7 | 0 | -5975 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Elmod1 | 0.75 | 0.84 |
| SLC30A4 | 0.71 | 0.79 |
| RIC8B | 0.71 | 0.72 |
| Tomm70a | 0.70 | 0.77 |
| KIAA1468 | 0.70 | 0.83 |
| DOCK4 | 0.69 | 0.75 |
| C9orf41 | 0.68 | 0.75 |
| MCTP1 | 0.68 | 0.73 |
| ptplb | 0.68 | 0.77 |
| TMEM19 | 0.68 | 0.76 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AP002478.3 | -0.50 | -0.63 |
| FXYD1 | -0.48 | -0.58 |
| Rab34 | -0.48 | -0.62 |
| DBI | -0.48 | -0.60 |
| slc2a4rg | -0.47 | -0.56 |
| C19orf36 | -0.46 | -0.58 |
| TLCD1 | -0.46 | -0.56 |
| ACSF2 | -0.46 | -0.58 |
| 云母 | -0.46 | -0.57 |
| CLDN10 | -0.46 | -0.53 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌转移DN | 121 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL CBP融合DN的王目标 | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林黑色素瘤副本编号DN | 41 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 游动乳腺癌预后不良 | 55 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li DCP2绑定mRNA | 89 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |