概括
基因 10533
象征 ATG7
同义词 类似apg7 | apg7l | gsa7
描述 自噬相关7
参考 MIM:608760|HGNC:HGNC:16935|Ensembl:ENSG00000197548|HPRD:12293|Vega:Otthumg00000129740
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P25.3
Pascal P值 0.112
Sherlock P值 0.104
胎儿β -1.679
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG20116569 3 11313900 ATG7 4.22E-8 -0.01 1.17E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003824 催化活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 11096062|11825910
去:0004839 泛素激活酶活性 塔斯 10233149
GO:0042803 蛋白质同构化活性 艾达 11096062
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006497 蛋白氨基酸脂肪 艾达 12890687
去:0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0006944 膜融合 塔斯 10233149
去:0006914 自噬 IEA -
去:0015031 蛋白质运输 IEA -
GO:0031401 蛋白质修饰过程的阳性调节 艾达 12890687
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 塔斯 10233149

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
自噬调节 35 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 212 129 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期DN 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mizushima自噬体形成 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因