基因页:ATG7
概括?
基因 | 10533 |
象征 | ATG7 |
同义词 | 类似apg7 | apg7l | gsa7 |
描述 | 自噬相关7 |
参考 | MIM:608760|HGNC:HGNC:16935|Ensembl:ENSG00000197548|HPRD:12293|Vega:Otthumg00000129740 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P25.3 |
Pascal P值 | 0.112 |
Sherlock P值 | 0.104 |
胎儿β | -1.679 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG20116569 | 3 | 11313900 | ATG7 | 4.22E-8 | -0.01 | 1.17E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ATG7_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003824 | 催化活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 11096062|11825910 | |
去:0004839 | 泛素激活酶活性 | 塔斯 | 10233149 | |
GO:0042803 | 蛋白质同构化活性 | 艾达 | 11096062 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006497 | 蛋白氨基酸脂肪 | 艾达 | 12890687 | |
去:0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0006944 | 膜融合 | 塔斯 | 10233149 | |
去:0006914 | 自噬 | IEA | - | |
去:0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
GO:0031401 | 蛋白质修饰过程的阳性调节 | 艾达 | 12890687 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 10233149 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
自噬调节 | 35 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome I类MHC介导的抗原加工表现 | 251 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome抗原加工泛素化蛋白酶体降解 | 212 | 129 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肺癌早期与晚期DN | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mizushima自噬体形成 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |