基因页:arpc1a
概括?
基因 | 10552 |
象征 | arpc1a |
同义词 | ARC40 | HEL-68 | HEL-S-307 | SOP2HS | SOP2L |
描述 | 肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基1a |
参考 | MIM:604220|HGNC:HGNC:703|ENSEMBL:ENSG00000241685|HPRD:07252|Vega:Otthumg00000154553 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q22.1 |
Pascal P值 | 0.79 |
Sherlock P值 | 0.923 |
胎儿β | 0.378 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | 结构可塑性 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04828509 | 7 | 98923380 | arpc1a | 3.18e-6 | -0.457 | 0.009 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARPC1A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GPR26 | 0.67 | 0.62 |
arhgap10 | 0.65 | 0.53 |
SYP | 0.65 | 0.64 |
LRRC53 | 0.63 | 0.47 |
C1orf183 | 0.62 | 0.57 |
ptprr | 0.62 | 0.60 |
VIT | 0.62 | 0.50 |
Styk1 | 0.62 | 0.63 |
ATF7IP2 | 0.62 | 0.56 |
弧 | 0.62 | 0.50 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPL23A | -0.32 | -0.35 |
SH2D2A | -0.31 | -0.33 |
Bcl7c | -0.28 | -0.32 |
GPR125 | -0.28 | -0.25 |
sigirr | -0.27 | -0.32 |
TP53BP2 | -0.27 | -0.19 |
AC132872.1 | -0.27 | -0.29 |
cdc42ep4 | -0.27 | -0.21 |
C21orf57 | -0.27 | -0.26 |
traf4 | -0.27 | -0.29 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG致病性大肠杆菌感染 | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡尔塔沙门氏菌途径 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta MPR途径 | 34 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Rho途径 | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CDC42RAC途径 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Actiny Pathway | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Olsson E2F3靶向 | 28 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON | 76 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC标记 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan晚分化基因上升 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G23 UP | 52 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hahtola CTCL皮肤 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇12的时间反应12 | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
萨森对促性腺营养蛋白的反应 | 91 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对Forskolin的反应 | 90 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huang Gata2靶向 | 149 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |