概括
基因 10552
象征 arpc1a
同义词 ARC40 | HEL-68 | HEL-S-307 | SOP2HS | SOP2L
描述 肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基1a
参考 MIM:604220|HGNC:HGNC:703|ENSEMBL:ENSG00000241685|HPRD:07252|Vega:Otthumg00000154553
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7Q22.1
Pascal P值 0.79
Sherlock P值 0.923
胎儿β 0.378
DMG 1(#研究)
支持 结构可塑性
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04828509 7 98923380 arpc1a 3.18e-6 -0.457 0.009 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GPR26 0.67 0.62
arhgap10 0.65 0.53
SYP 0.65 0.64
LRRC53 0.63 0.47
C1orf183 0.62 0.57
ptprr 0.62 0.60
VIT 0.62 0.50
Styk1 0.62 0.63
ATF7IP2 0.62 0.56
0.62 0.50
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPL23A -0.32 -0.35
SH2D2A -0.31 -0.33
Bcl7c -0.28 -0.32
GPR125 -0.28 -0.25
sigirr -0.27 -0.32
TP53BP2 -0.27 -0.19
AC132872.1 -0.27 -0.29
cdc42ep4 -0.27 -0.21
C21orf57 -0.27 -0.26
traf4 -0.27 -0.29

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG致病性大肠杆菌感染 59 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡尔塔沙门氏菌途径 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MPR途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Rho途径 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CDC42RAC途径 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Actiny Pathway 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 177 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Olsson E2F3靶向 28 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON 76 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC标记 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan晚分化基因上升 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G23 UP 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hahtola CTCL皮肤 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇12的时间反应12 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨森对促性腺营养蛋白的反应 91 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin的反应 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang Gata2靶向 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因