基因页:AGPAT1
概括?
基因 | 10554 |
象征 | AGPAT1 |
同义词 | 1-agpat1 | g15 | lpaat-alpha | lpaata |
描述 | 1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶1 |
参考 | MIM:603099|HGNC:HGNC:324|Ensembl:ENSG00000204310|HPRD:04372|Vega:Otthumg00000031210 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p21.3 |
Pascal P值 | 1E-12 |
Sherlock P值 | 0.149 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AGPAT1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C17orf28 | 0.82 | 0.82 |
ATP13A2 | 0.80 | 0.79 |
TMEM25 | 0.80 | 0.82 |
scyl1 | 0.80 | 0.80 |
dbndd1 | 0.80 | 0.80 |
CAND2 | 0.79 | 0.78 |
SLC5A2 | 0.79 | 0.79 |
dennd4b | 0.79 | 0.79 |
TAF6 | 0.79 | 0.78 |
REEP2 | 0.79 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.63 | -0.54 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.48 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.47 |
MT-CO2 | -0.57 | -0.48 |
GNG11 | -0.56 | -0.55 |
MT-ATP8 | -0.56 | -0.52 |
AF347015.18 | -0.55 | -0.47 |
AF347015.2 | -0.54 | -0.44 |
mt-cyb | -0.53 | -0.44 |
鼻孔 | -0.52 | -0.44 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003841 | 1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶活性 | nas | 9461603 | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008415 | 酰基转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0046027 | 磷脂:二酰基甘油酰基转移酶活性 | 经验 | 9461603 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008654 | 磷脂生物合成过程 | IEA | - | |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0006654 | 磷脂酸生物合成过程 | 塔斯 | 9461603 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 9461603 | |
去:0005783 | 内质网 | 塔斯 | 9461603 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG甘油代谢 | 49 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG甘油磷脂代谢 | 77 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组甘油三酸酯的生物合成 | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PA的反应组合成 | 27 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组甘油磷脂生物合成 | 82 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
能量代谢的反应组整合 | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4 DN发出信号 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏4NQO或伽马辐射 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肺癌早期与晚期DN | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-143 | 271 | 277 | M8 | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
mir-181 | 147 | 153 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-328 | 76 | 83 | 1A,M8 | HSA-MIR-328脑 | cuggcccucugccuuccgu |
mir-488 | 1020 | 1027 | 1A,M8 | HSA-MIR-488 | cccagauauggcacucucucaa |