概括
基因 10554
象征 AGPAT1
同义词 1-agpat1 | g15 | lpaat-alpha | lpaata
描述 1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶1
参考 MIM:603099|HGNC:HGNC:324|Ensembl:ENSG00000204310|HPRD:04372|Vega:Otthumg00000031210
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.3
Pascal P值 1E-12
Sherlock P值 0.149

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C17orf28 0.82 0.82
ATP13A2 0.80 0.79
TMEM25 0.80 0.82
scyl1 0.80 0.80
dbndd1 0.80 0.80
CAND2 0.79 0.78
SLC5A2 0.79 0.79
dennd4b 0.79 0.79
TAF6 0.79 0.78
REEP2 0.79 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.63 -0.54
AF347015.31 -0.57 -0.48
AF347015.8 -0.57 -0.47
MT-CO2 -0.57 -0.48
GNG11 -0.56 -0.55
MT-ATP8 -0.56 -0.52
AF347015.18 -0.55 -0.47
AF347015.2 -0.54 -0.44
mt-cyb -0.53 -0.44
鼻孔 -0.52 -0.44

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003841 1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶活性 nas 9461603
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008415 酰基转移酶活性 IEA -
GO:0046027 磷脂:二酰基甘油酰基转移酶活性 经验 9461603
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008654 磷脂生物合成过程 IEA -
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0006654 磷脂酸生物合成过程 塔斯 9461603
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 9461603
去:0005783 内质网 塔斯 9461603
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG甘油代谢 49 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG甘油磷脂代谢 77 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油三酸酯的生物合成 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PA的反应组合成 27 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
能量代谢的反应组整合 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1通过SMAD4 DN发出信号 66 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO或伽马辐射 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期DN 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-143 271 277 M8 HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-181 147 153 M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-328 76 83 1A,M8 HSA-MIR-328 cuggcccucugccuuccgu
mir-488 1020 1027 1A,M8 HSA-MIR-488 cccagauauggcacucucucaa