概括
基因 10581
象征 ifitm2
同义词 1-8D | DSPA2C
描述 干扰素诱导的跨膜蛋白2
参考 MIM:605578|HGNC:HGNC:5413|Ensembl:ENSG00000185201|HPRD:05718|Vega:Otthumg00000165357
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.5
Pascal P值 0.875
胎儿β -1.344
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.57
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS553106 Chr11 82939896 ifitm2 10581 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL008723.6 0.95 0.94
GLS2 0.84 0.87
AVPI1 0.83 0.81
C6orf136 0.83 0.83
ABTB1 0.82 0.78
DHRS11 0.81 0.81
P2RX6 0.81 0.83
AC068580.3 0.81 0.80
LPCAT4 0.80 0.85
C22ORF25 0.79 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
pde9a -0.45 -0.48
tubb2b -0.45 -0.49
KIAA1949 -0.45 -0.40
SH3BP2 -0.44 -0.51
RBMX2 -0.44 -0.52
CD24 -0.43 -0.20
marcksl1 -0.43 -0.35
IGF2BP3 -0.43 -0.43
carhsp1 -0.43 -0.48
nkiras2 -0.43 -0.23

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003674 Molecular_Function nd 6548414
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15231747
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009607 对生物刺激的反应 IEA -
去:0008150 生物_Process nd 6548414
去:0006955 免疫反应 塔斯 1906403
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd 6548414
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome干扰素αβ信号传导 64 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 DN 67 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Appierto对Fenretinide DN的反应 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU AKT1目标6小时 27 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radaeva对IFNA1的响应 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL融合一起 87 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对甲氨蝶呤DN的Brachat响应 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Smarca4目标 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brachat对Camptothecin DN的反应 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab失败心室DN 41 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对丁酸酯Sulindac 6的反应 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim LRC3B目标 30 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马洛尼对17aag的回应 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jiang Tip30目标 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee早期T淋巴细胞DN 57 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7目标2 DN 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因