基因页:ifitm2
概括?
基因 | 10581 |
象征 | ifitm2 |
同义词 | 1-8D | DSPA2C |
描述 | 干扰素诱导的跨膜蛋白2 |
参考 | MIM:605578|HGNC:HGNC:5413|Ensembl:ENSG00000185201|HPRD:05718|Vega:Otthumg00000165357 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.5 |
Pascal P值 | 0.875 |
胎儿β | -1.344 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS553106 | Chr11 | 82939896 | ifitm2 | 10581 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL008723.6 | 0.95 | 0.94 |
GLS2 | 0.84 | 0.87 |
AVPI1 | 0.83 | 0.81 |
C6orf136 | 0.83 | 0.83 |
ABTB1 | 0.82 | 0.78 |
DHRS11 | 0.81 | 0.81 |
P2RX6 | 0.81 | 0.83 |
AC068580.3 | 0.81 | 0.80 |
LPCAT4 | 0.80 | 0.85 |
C22ORF25 | 0.79 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
pde9a | -0.45 | -0.48 |
tubb2b | -0.45 | -0.49 |
KIAA1949 | -0.45 | -0.40 |
SH3BP2 | -0.44 | -0.51 |
RBMX2 | -0.44 | -0.52 |
CD24 | -0.43 | -0.20 |
marcksl1 | -0.43 | -0.35 |
IGF2BP3 | -0.43 | -0.43 |
carhsp1 | -0.43 | -0.48 |
nkiras2 | -0.43 | -0.23 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | 6548414 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009607 | 对生物刺激的反应 | IEA | - | |
去:0008150 | 生物_Process | nd | 6548414 | |
去:0006955 | 免疫反应 | 塔斯 | 1906403 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005575 | cellular_component | nd | 6548414 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome干扰素αβ信号传导 | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 DN | 67 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Appierto对Fenretinide DN的反应 | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU AKT1目标6小时 | 27 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Radaeva对IFNA1的响应 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando T与MLL融合一起 | 87 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对甲氨蝶呤DN的Brachat响应 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin的反应 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Smarca4目标 | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Brachat对Camptothecin DN的反应 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab失败心室DN | 41 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对丁酸酯Sulindac 6的反应 | 52 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim LRC3B目标 | 30 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马洛尼对17aag的回应 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jiang Tip30目标 | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee早期T淋巴细胞DN | 57 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7目标2 DN | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |