基因页面:MTHFS
总结吗?
| GeneID | 10588年 |
| 象征 | MTHFS |
| 同义词 | HsT19268 |
| 描述 | 5,10-methenyltetrahydrofolate合成酶(5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase) |
| 参考 | MIM: 604197|HGNC: HGNC: 7437|HPRD: 09174|织女:OTTHUMG00000144174 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 15 q25.1 |
| 夏洛克假定值 | 0.028 |
| 胎儿β | -1.056 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg07699440 | 15 | 80445357 | MTHFS | 0.002 | 5.882 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2204607 | chr7 | 141709693 | MTHFS | 10588年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs1956083 | chr14 | 49665407 | MTHFS | 10588年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs1956082 | chr14 | 49665495 | MTHFS | 10588年 | 0.14 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TAOK1 | 0.94 | 0.95 |
| XPO4 | 0.92 | 0.94 |
| CEP97 | 0.91 | 0.94 |
| 对于SETX | 0.91 | 0.94 |
| RIF1 | 0.91 | 0.93 |
| AFF4 | 0.91 | 0.94 |
| MYO9A | 0.91 | 0.93 |
| ZBTB44 | 0.90 | 0.93 |
| RICTOR | 0.90 | 0.94 |
| SAMD8 | 0.90 | 0.94 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.63 | -0.70 |
| MT-CO2 | -0.62 | -0.71 |
| FXYD1 | -0.62 | -0.69 |
| HIGD1B | -0.61 | -0.71 |
| AF347015.21 | -0.61 | -0.72 |
| IFI27 | -0.60 | -0.68 |
| AF347015.8 | -0.60 | -0.68 |
| ENHO | -0.59 | -0.69 |
| AF347015.33 | -0.59 | -0.64 |
| MT-CYB | -0.59 | -0.65 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG叶酸一个碳池 | 17 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAZDA钻石BLACKFAN贫血红细胞DN | 493年 | 298年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 奥斯曼膀胱癌DN | 406年 | 230年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲 | 479年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN FOXP3目标集群T4 | 94年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| S3 HOSHIDA肝癌子类 | 266年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN VANLOO SP3目标 | 89年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |