基因页：scgn

概括？
基因 10590
象征 scgn
同义词 calbl | dj501n12.8 |秘密| segn | setagin
描述 促毒素，EF手钙结合蛋白
参考 MIM：609202|HGNC：HGNC：16941|Ensembl：ENSG0000000079689|HPRD：10211|Vega：Otthumg0000000014409
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p22.3-p22.1
Pascal P值 2.853E-4
胎儿β 2.617
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.033

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1325252 CHR1 34431772 scgn 10590 0.02 反式
RS17392743 CHR1 54764240 scgn 10590 0.04 反式
RS2297760 CHR1 152487033 scgn 10590 0.15 反式
RS16823145 CHR1 184397914 scgn 10590 0 反式
RS10494876 CHR1 206610117 scgn 10590 0.19 反式
RS12405921 CHR1 206695730 scgn 10590 0.09 反式
RS17187394 CHR1 208569242 scgn 10590 0.06 反式
RS17025528 CHR1 216043152 scgn 10590 0.04 反式
RS17572651 CHR1 218943612 scgn 10590 7.845e-4 反式
RS1934584 CHR1 245971711 scgn 10590 0.05 反式
RS16829545 CHR2 151977407 scgn 10590 1.277E-18 反式
RS7584986 CHR2 184111432 scgn 10590 0.01 反式
RS6741060 CHR2 217169088 scgn 10590 3.826e-5 反式
RS17060743 CHR3 59445697 scgn 10590 0.02 反式
RS9861691 CHR3 95639191 scgn 10590 0.18 反式
RS16853287 CHR3 142984245 scgn 10590 0.18 反式
RS7635430 CHR3 180152035 scgn 10590 0.04 反式
RS16882010 CHR4 11453741 scgn 10590 0.01 反式
RS16878852 CHR4 27115684 scgn 10590 9.517E-7 反式
RS17572822 CHR4 27123560 scgn 10590 0.03 反式
RS2407220 CHR4 152193824 scgn 10590 0.01 反式
RS17028403 CHR4 152943625 scgn 10590 0.06 反式
RS1480540 CHR4 171103335 scgn 10590 0.02 反式
RS3111196 CHR5 54402889 scgn 10590 0.05 反式
RS17762315 CHR5 76807576 scgn 10590 2.248e-7 反式
RS7729096 CHR5 76835927 scgn 10590 0.15 反式
RS443095 CHR5 79362549 scgn 10590 0.1 反式
RS3777174 CHR5 95280552 scgn 10590 0 反式
RS6893788 CHR5 95335085 scgn 10590 0 反式
RS10515234 CHR5 95336330 scgn 10590 0 反式
SNP_A-2174305 0 scgn 10590 0.03 反式
RS17452260 CHR5 107607108 scgn 10590 0 反式
RS887375 CHR5 126458125 scgn 10590 0.15 反式
RS11955168 CHR5 131956906 scgn 10590 0.02 反式
RS13360496 0 scgn 10590 0.05 反式
RS9340817 CHR6 152175105 scgn 10590 0.18 反式
RS10271456 CHR7 25498908 scgn 10590 0.01 反式
RS3857726 CHR7 25503390 scgn 10590 0.01 反式
RS9969299 CHR7 25513687 scgn 10590 0.01 反式
RS7777722 CHR7 26488550 scgn 10590 0.09 反式
RS10253181 CHR7 26563022 scgn 10590 0.04 反式
RS12706918 CHR7 80266147 scgn 10590 0.02 反式
RS6467660 CHR7 136132857 scgn 10590 0.11 反式
RS17079498 CHR8 3018343 scgn 10590 0.07 反式
RS10505367 CHR8 120591463 scgn 10590 0.02 反式
RS2305128 CHR8 120599486 scgn 10590 0.02 反式
RS6583554 CHR8 143022152 scgn 10590 0.18 反式
RS11139334 Chr9 84209393 scgn 10590 0.01 反式
RS7041027 Chr9 126744530 scgn 10590 0.09 反式
RS10122864 Chr9 134991712 scgn 10590 0.19 反式
RS1009138 Chr9 135000607 scgn 10590 0.17 反式
RS11254048 Chr10 6729510 scgn 10590 0.2 反式
RS17140456 Chr10 6730309 scgn 10590 0.11 反式
RS2935286 Chr10 34332326 scgn 10590 0.02 反式
RS2393316 Chr10 59333070 scgn 10590 8.251E-5 反式
RS11185824 Chr10 91393711 scgn 10590 0.01 反式
RS1902708 Chr10 98004531 scgn 10590 0.14 反式
RS11190310 Chr10 101659518 scgn 10590 0 反式
RS11190338 Chr10 101713253 scgn 10590 0.01 反式
RS17124813 Chr10 110347464 scgn 10590 0.11 反式
RS1335014 Chr10 130004943 scgn 10590 0.05 反式
RS12289208 Chr11 125224267 scgn 10590 8.569e-4 反式
RS749881 Chr11 125224856 scgn 10590 0.01 反式
RS11061703 CHR12 1436977 scgn 10590 0.03 反式
RS2638324 0 scgn 10590 0.05 反式
RS12315969 CHR12 67498529 scgn 10590 0.02 反式
RS1526959 CHR12 79753789 scgn 10590 0 反式
RS1547161 CHR13 30552900 scgn 10590 0.12 反式
RS7337967 CHR13 53519044 scgn 10590 0.14 反式
RS4112777 CHR13 99281457 scgn 10590 0.07 反式
RS10498433 CHR14 52289530 scgn 10590 0.03 反式
RS17108303 CHR14 79305092 scgn 10590 0.07 反式
RS17111984 CHR14 95881425 scgn 10590 0.1 反式
RS16955618 CHR15 29937543 scgn 10590 1.447E-20 反式
RS17711752 CHR16 34436184 scgn 10590 0.13 反式
RS12597471 CHR16 53678428 scgn 10590 0.14 反式
RS2270919 CHR16 58150942 scgn 10590 0.09 反式
RS3809597 CHR16 58163518 scgn 10590 0.01 反式
RS11076222 CHR16 58239497 scgn 10590 0.02 反式
RS11873184 CHR18 1584081 scgn 10590 0.17 反式
RS12458173 CHR18 31430166 scgn 10590 0.17 反式
RS2000894 CHR18 57219161 scgn 10590 0.15 反式
RS6046863 CHR20 20423018 scgn 10590 0.01 反式
RS1041786 CHR21 22617710 scgn 10590 2.52E-4 反式
RS16986332 Chrx 10958354 scgn 10590 0.03 反式
RS3829726 Chrx 72666188 scgn 10590 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 nas 10811645
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0008150 生物_Process nd -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -
去：0005737 细胞质 nas 10811645
去：0016020 膜 IEA -
GO：0031410 细胞质囊泡 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB目标1 DN 38 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS HCP与H3未甲基化 80 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
角色glis3目标 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因