基因页：PAICS

概括?
GeneID 10606
Symbol PAICS
同义词 ADE2|ADE2H1|AIRC|PAIS
描述 phosphoribosylaminoimidazole carboxylase; phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase
参考 MIM：172439|HGNC:HGNC:8587|Ensembl:ENSG00000128050|HPRD:01401|Vega:OTTHUMG00000160957
Gene type protein-coding
地图位置 4q12
Pascal P值 0.047
Sherlock P值 0.101
Fetal beta 0.173
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
CV：GWASDB 全基因组关联研究 gwasdbrecords for schizophrenia
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.0044

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg13086586 4 57303149 PAICS; PPAT 4.07E-4 -0.217 0.044 DMG:Wockner_2014


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0003824 catalytic activity IEA -
GO:0004638 phosphoribosylaminoimidazole carboxylase activity IEA -
GO:0004639 磷酸氨基氨基氨基二唑磺酰辅酰胺合酶活性 IEA -
GO:0004639 磷酸氨基氨基氨基二唑磺酰辅酰胺合酶活性 塔斯 2253271
GO:0005524 ATP结合 IEA -
GO：0016829 lyase activity IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
GO:0042802 相同的蛋白质结合 新闻学会 16169070
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0006189 'de novo' IMP biosynthetic process IEA -
GO:0006164 purine nucleotide biosynthetic process IEA -
去：0009113 purine base biosynthetic process 塔斯 2253271
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0009320 磷酸氨基氨基咪唑羧化酶复合物 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
CEP76 C18orf9 | FLJ12542 | HsT1705 centrosomal protein 76kDa 两个杂交 BioGRID 16189514
CHD3 Mi-2a |mi2-alpha |ZFH 染色体群酶DNA结合蛋白3 两个杂交 BioGRID 16169070
DGKE dagk6 |DGK diacylglycerol kinase, epsilon 64kDa 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
EIF6 2 |出租车|EIF3A |itgb4bp |b |B（2）GCN |GCN |P27BBP 真核翻译引发因子6 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
EPB41 4.1R | EL1 | HE erythrocyte membrane protein band 4.1 (elliptocytosis 1, RH-linked) 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
FXR2 FMR1L2 脆弱的X心理迟缓，常染色体同源物2 两个杂交 BioGRID 16189514
gnas Aho |C20orf45 |GNAS1 |GPSA |GSA |GSP |MGC33735 |php1a |php1b |poh | dJ309F20.1.1 | dJ806M20.3.3 gnascomplex locus 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
HLA-B AS | HLA-B-7301 | HLA-B73 | HLAB | HLAC | SPDA1 主要的组织相容性复合物，I类，B 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
LNX1 lnx |mpdz |PDZRN2 Numb蛋白X 1的配体 两个杂交 BioGRID 16189514
MCC DKFZP762O1615 |FLJ38893 |FLJ46755 |MCC1 mutated in colorectal cancers 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
mobkl3 2C4D | CGI-95 | MGC12264 | MOB1 | MOB3 | PREI3 MOB1，MPS一个粘合激酶激活剂样3（酵母） 两个杂交 BioGRID 16169070
NUDT18 FLJ22494 nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 18 两个杂交 BioGRID 16189514
PAICS ADE2 |ADE2H1 |AIRC |DKFZP781N1372 |MGC1343 |MGC5024 |佩斯 磷酸氨基氨基咪唑羧化酶，磷酸氨基氨基咪唑辅助辅助酰胺合成酶合成酶 两个杂交 BioGRID 16169070|16189514
PSMC4 MGC13687 | MGC23214 | MGC8570 | MIP224 | S6 | TBP7 蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，ATPase，4 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
STAU1 FLJ25010 | STAU Staufen，RNA结合蛋白，同源1（果蝇） Stau1 interacts with PAICS. BIND 15680326
TRAF6 MGC：3310 |RNF85 TNF受体相关因子6 亲和力捕获ms BioGRID 17353931


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
核苷酸的反应组代谢 72 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PURINE RIBONUCLEOSIDE MONOPHOSPHATE BIOSYNTHESIS 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组嘌呤代谢 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 UP 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG RESPONSE TO AZACITIDINE AND TSA DN 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEURIG T细胞PROLYMPHOCYTIC白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL UP 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAHTOLA MYCOSIS FUNGOIDES CD4 DN 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MISSIAGLIA REGULATED BY METHYLATION DN 122 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATTIOLI MGUS VS PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶标和血清反应DN 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYC AMPLIFICATION TARGETS UP 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOMLINS PROSTATE CANCER UP 40 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT NETWORK 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA CENTERED NETWORK 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
INGRAM SHH TARGETS UP 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC TARGETS WITH EBOX 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERNANDEZ BOUND BY MYC 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUHMACHER MYC TARGETS UP 80 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标UP 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德斯癌元签名 64 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD MYC ONCOGENIC SIGNATURE 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY E2F4 UNSTIMULATED 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALONSO METASTASIS UP 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG CORE SERUM RESPONSE UP 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE RECENT THYMIC EMIGRANT 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN MYELOMA VS MATURE B LYMPHOCYTE 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN ACTIVATED B LYMPHOCYTE 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN ACTIVATED DENDRITIC CELL 65 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINNEPENNINCKX MELANOMA METASTASIS UP 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR UP 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PANGAS TUMOR SUPPRESSION BY SMAD1 AND SMAD5 UP 134 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILANGES RAPAMYCIN SENSITIVE VIA TSC1 AND TSC2 73 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALFANO MYC TARGETS 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 6HR 85 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 24HR 128 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因