SZGR2 - Beplay体育中心

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基因	10611
象征	pDLIM5
Synonyms	ENH \| ENH1 \| L9 \| LIM
Description	PDZ和LIM域5
Reference	MIM：605904\|HGNC:HGNC:17468\|ENSEMBL：ENSG00000163110\|HPRD：05799\|Vega：Otthumg00000130973
基因类型	蛋白质编码
Map location	4Q22
Pascal P值	0.496
Sherlock p-value	0.491
胎儿β	0.238
主持人	尾状基底神经节

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID：cooccur	High-throughput literature-search	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会	A combined odds ratio method (Sun等。2008), association studies	2	链接到SZGene
表达	Meta-analysis of gene expression	p价值：1.438
Literature	High-throughput literature-search	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
prkar2b	0.85	0.90
vldlr	0.84	0.90
KIAA1383	0.83	0.86
terf2	0.83	0.88
GALNT2	0.83	0.83
STX6	0.83	0.89
SH3BP5	0.82	0.88
myt1l	0.82	0.89
Arih1	0.82	0.87
ZNF248	0.82	0.87

前10个负共表达基因
Gene	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
MT-CO2	-0.73	-0.81
AF347015.31	-0.72	-0.80
AF347015.33	-0.71	-0.78
AF347015.8	-0.70	-0.80
mt-cyb	-0.70	-0.78
HSD17B14	-0.70	-0.78
FXYD1	-0.70	-0.80
HIGD1B	-0.70	-0.81
AF347015.27	-0.70	-0.78
AIFM3	-0.69	-0.75

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0003779	肌动蛋白结合	ISS		-
去：0005080	蛋白激酶C结合	ISS		-
去：0005515	蛋白质结合	IEA		-
去：0008270	锌离子结合	IEA		-
GO：0042805	阳历原结合	ISS		-
GO：0046872	metal ion binding	IEA		-
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0005829	细胞质	ISS		-
去：0005624	膜分数	ISS		-
去：0030018	Z光盘	IEA		-
GO:0015629	肌动蛋白细胞骨架	艾达		11256614

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤	205	140	All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘前列腺癌	96	57	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Liu Sox4靶向DN	309	191	All SZGR 2.0 genes in this pathway
THUM收缩心力衰竭DN	244	147	All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病	1382	904	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LAIHO大肠癌锯齿状的D UP	112	71	All SZGR 2.0 genes in this pathway
GAL LEUKEMIC STEM CELL UP	133	78	All SZGR 2.0 genes in this pathway
OSMAN BLADDER CANCER UP	404	246	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1签名3	341	197	All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP	185	126	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee神经Crest干细胞DN	118	79	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP	431	237	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nagashima NRG1信号向上发出	176	123	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim WT1靶向	214	155	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN	805	505	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌变性DN	537	339	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN	781	465	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡	1142	669	All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN UP	612	367	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上	170	114	All SZGR 2.0 genes in this pathway
EBAUER TARGETS OF PAX3 FOXO1 FUSION UP	207	128	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN	88	71	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX3 FOXO1融合的Ebauer肌原靶标	50	26	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Seitz肿瘤转化通过8p删除	73	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN	855	609	All SZGR 2.0 genes in this pathway
王HCP前列腺癌	111	69	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tomlins前列腺癌	40	27	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN	584	395	All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过ELK3 DN的缺氧总缺氧	156	106	All SZGR 2.0 genes in this pathway
仅通过ELK3的高缺氧	33	18	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buytaert光动力疗法应力DN	637	377	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应240 HELA	60	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应480 HELA	164	118	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应60 MCF10A	39	24	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Amit EGF响应120 MCF10A	43	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿米特血清反应60 mcf10a	57	42	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿米特血清反应120 MCF10A	65	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿米特血清反应240 MCF10A	57	36	All SZGR 2.0 genes in this pathway
IIZUKA LIVER CANCER PROGRESSION G1 G2 UP	12	9	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NELSON RESPONSE TO ANDROGEN UP	86	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fab M7类型的Ross Aml	68	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn	546	351	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK	63	48	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者	555	346	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN	408	274	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN	371	218	All SZGR 2.0 genes in this pathway
大脑衰老	262	186	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAZARD RESPONSE TO UV NHEK UP	244	151	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kaab心脏中心与心室DN	261	183	All SZGR 2.0 genes in this pathway
贝尔德糖尿病性肾病DN	434	302	All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard UV响应集群G1	67	41	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 3	720	440	All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE DN	220	147	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE DN	409	268	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默	461	298	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向	673	430	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53靶向	602	364	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向	601	369	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜	425	298	All SZGR 2.0 genes in this pathway
p210 bcr abl融合的射线目标	18	13	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3	1069	729	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KESHELAVA MULTIPLE DRUG RESISTANCE	88	56	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA DN	267	160	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHANDRAN METASTASIS UP	221	135	All SZGR 2.0 genes in this pathway
gregory合成致死与伊马替尼	145	83	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoelzel NF1靶向	139	93	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR DN	505	328	All SZGR 2.0 genes in this pathway
pasini suz12靶向DN	315	215	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ewsr1 fli1融合的骨靶标	271	165	All SZGR 2.0 genes in this pathway
phong tnf响应不是通过p38	337	236	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 1类由EGF瞬时诱导	516	308	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
miR-15/16/195/424/497	2376	2382	M8	HSA-MIR-15A^brain	uagcagcacauaugguugug
				hsa-miR-16^brain	UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG
				HSA-MIR-15B^brain	uagcagcacaucaugguuaca
				HSA-MIR-195^SZ	uagcagaaaaauauuggc
				hsa-miR-424	Cagcagcaauucauguuuugaa
				HSA-MIR-497	cagcagcacacuguguuugu

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：pDLIM5