基因页：TXNIP

概括?
GeneID 10628
Symbol TXNIP
同义词 EST01027 | HHCPA78 | THIF | VDUP1
描述 thioredoxin interacting protein
参考 MIM:606599|HGNC:HGNC:16952|Ensembl：ENSG00000265972|HPRD:05964|Vega:OTTHUMG00000013755
Gene type protein-coding
地图位置 1q21.1
Sherlock P值 0.377
Fetal beta 0.906
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 Info
CNV:YES 拷贝数变异研究 手动策划
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） Psr: 0.00814
Expression 基因表达的荟萃分析 P价值：2.157

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS11211366 chr1 47276241 TXNIP 10628 0.06 trans
RS6596786 chr6 1103241 TXNIP 10628 0.19 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding 新闻学会 14632196
去：0004857 酶抑制剂活性 IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006355 regulation of transcription, DNA-dependent IEA -
GO:0006350 transcription IEA -
去：0007049 细胞周期 IEA -
GO:0006979 response to oxidative stress IEA -
GO:0030216 角质形成细胞分化 艾达 14632196
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005737 细胞质 艾达 14632196

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
REACTOME INNATE IMMUNE SYSTEM 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NLRP3炎性体 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INFLAMMASOMES 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN LEUCINE RICH REPEAT CONTAINING RECEPTOR NLR SIGNALING PATHWAYS 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS UP 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS UP 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASAKI YBX1 TARGETS UP 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LMO4 TARGETS UP 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂红色DN的反应 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOEBEKE LYMPHOID STEM CELL DN 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗 78 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2向上 139 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN NPM1 SIGNATURE 3 UP 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC和TFRC的Odonnell目标 83 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG UP 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAHTOLA MYCOSIS FUNGOIDES SKIN UP 177 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PROVENZANI METASTASIS UP 194 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Naderi乳腺癌预后DN 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲基化调节的米西亚利亚 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKS HDAC TARGETS UP 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUMMERICH SKIN CANCER PROGRESSION DN 100 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dirmeier LMP1响应晚期DN 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG HCP PROSTATE CANCER 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 AND HIF1A DN 103 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERTUCCI INVASIVE CARCINOMA DUCTAL VS LOBULAR DN 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU CELL MIGRATION 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应20 Hela 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 TARGETS UP 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT UP 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOUSTIS ROS 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG LEUCINE DEPRIVATION UP 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF信号DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KENNY CTNNB1 TARGETS DN 52 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIPP DLBCL VS FOLLICULAR LYMPHOMA DN 45 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG GLUCOSE DEPRIVATION DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO HYPOXIA UP 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hemin的addya红斑分化 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galindo对肠毒素的免疫反应 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对顺铂的反应 22 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL LONG TERM 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
敏锐的回应罗格列酮 38 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对甲氨蝶呤的反应 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gajate对trabectedin的反应 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takao对UVB辐射DN的响应 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRACHAT RESPONSE TO CAMPTOTHECIN UP 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG HYPOXIA NORMAL 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VARELA ZMPSTE24 TARGETS UP 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARTIPY NORMAL AT INSULIN RESISTANCE DN 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lein脉络丛标记 103 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS UP 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COATES MACROPHAGE M1 VS M2 UP 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向DN 97 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAY TUMORIGENESIS BY ERBB2 CDC25A DN 159 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI GLUCOSE DEPRIVATION 60 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞 200 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移DN 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI DNAJB4靶向 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞SCP2 QTL Trans 25 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇1的时间反应1 68 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA ADIPOGENESIS LATE UP 104 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI INDUCED T TO NATURAL KILLER DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯托莫斯基对维生素D3 DN的反应 26 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEMAGALHAES AGING UP 55 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OHGUCHI LIVER HNF4A TARGETS UP 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KASLER HDAC7 TARGETS 1 DN 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARDIN HYPOXIA 11 32 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS UP 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 36HR 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG GATA2 TARGETS UP 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标1小时DN 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Guillaumond KLF10靶向DN 30 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PECE MAMMARY STEM CELL DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 2ND EGF PULSE ONLY 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-148/152 702 708 m8 HSA-MIR-148A UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa-miR-152脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
HSA-MIR-148B UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 1193 1199 m8 HSA-MIR-17-5P CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
hsa-miR-519d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
HSA-MIR-17-5P CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
hsa-miR-519d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 1192 1198 m8 hsa-miR-93脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
HSA-MIR-302A UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
hsa-miR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
hsa-miR-373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
hsa-miR-520e AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
HSA-MIR-520C AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
HSA-MIR-520D AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU