基因页：taf6l
概括？
| 基因 | 10629 |
| 象征 | taf6l |
| 同义词 | PAF65A |
| 描述 | tata-box结合蛋白相关因子6 |
| 参考 | MIM：602946|HGNC：HGNC：17305|ENSEMBL：ENSG00000162227|HPRD：04253|Vega：Otthumg00000167610 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 11q12.3 |
| Pascal P值 | 0.438 |
| Sherlock P值 | 0.049 |
| 胎儿beta | -0.211 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG19905802 | 11 | 62554200 | TMEM179B; TAF6L | 4.295E-4 | -0.298 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26后概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共同表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| mtmr6 | 0.95 | 0.95 |
| UHRF1BP1L | 0.93 | 0.92 |
| TRIM23 | 0.92 | 0.92 |
| RPRD1A | 0.92 | 0.93 |
| PJA2 | 0.92 | 0.93 |
| CASD1 | 0.91 | 0.89 |
| PPP2R5C | 0.91 | 0.90 |
| GRSF1 | 0.91 | 0.89 |
| cltc | 0.91 | 0.91 |
| Trim37 | 0.91 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.61 | -0.46 |
| AF347015.18 | -0.59 | -0.53 |
| MT-CO2 | -0.57 | -0.48 |
| higd1b | -0.57 | -0.48 |
| AF347015.26 | -0.57 | -0.44 |
| AF347015.8 | -0.56 | -0.47 |
| AF347015.2 | -0.56 | -0.44 |
| EIF4EBP3 | -0.56 | -0.59 |
| FXYD1 | -0.56 | -0.51 |
| AP002478.3 | -0.56 | -0.54 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg基础转录因子 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨型性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向12小时 | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Olsson E2F3靶向DN | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 田中甲基化食管癌中的甲基化 | 103 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAGY TFTC组件人类 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nagy Staga组件人 | 15 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAGY PCAF组件人 | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MYC增强的Schlosser血清反应 | 108 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sakai肿瘤浸润单核细胞DN | 81 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 皮肤上的theilgaard中性粒细胞 | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |