概括
基因 10634
象征 GAS2L1
同义词 GAR22
描述 增长逮捕比2这样的2
参考 MIM:602128|HGNC:HGNC:16955|ENSEMBL:ENSG00000185340|HPRD:03676|Vega:Otthumg00000151108
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q12.2
Pascal P值 0.204
Sherlock P值 0.581
胎儿β -1.219
主持人 小脑半球
小脑
皮质
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS909798 22 29654004 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.729E-7 0 -48568 gtex_brain_putamen_basal
RS2857466 22 29657604 GAS2L1 ENSG00000185340.11 3.188e-7 0 -44968 gtex_brain_putamen_basal
RS2301291 22 29664423 GAS2L1 ENSG00000185340.11 5.214e-7 0 -38149 gtex_brain_putamen_basal
RS9613857 22 29679713 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.208E-7 0 -22859 gtex_brain_putamen_basal
RS3761426 22 29688632 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.227E-7 0 -13940 gtex_brain_putamen_basal
RS3747142 22 29693990 GAS2L1 ENSG00000185340.11 1.656E-7 0 -8582 gtex_brain_putamen_basal
RS2301586 22 29702910 GAS2L1 ENSG00000185340.11 4.668E-7 0 338 gtex_brain_putamen_basal
RS9613859 22 29703409 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.774E-7 0 837 gtex_brain_putamen_basal
RS142333573 22 29706244 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.501E-7 0 3672 gtex_brain_putamen_basal
RS9613860 22 29707955 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.025E-7 0 5383 gtex_brain_putamen_basal
RS3216803 22 29708796 GAS2L1 ENSG00000185340.11 3.082e-7 0 6224 gtex_brain_putamen_basal
RS71700945 22 29712522 GAS2L1 ENSG00000185340.11 1.092E-7 0 9950 gtex_brain_putamen_basal
RS6006093 22 29719167 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.194E-8 0 16595 gtex_brain_putamen_basal
RS9613863 22 29721902 GAS2L1 ENSG00000185340.11 3.548e-8 0 19330 gtex_brain_putamen_basal
RS9613864 22 29728854 GAS2L1 ENSG00000185340.11 4.309E-8 0 26282 gtex_brain_putamen_basal
RS3747146 22 29735310 GAS2L1 ENSG00000185340.11 9.375E-9 0 32738 gtex_brain_putamen_basal
RS715589 22 29743779 GAS2L1 ENSG00000185340.11 7.725e-9 0 41207 gtex_brain_putamen_basal
RS737883 22 29746253 GAS2L1 ENSG00000185340.11 5.014E-6 0 43681 gtex_brain_putamen_basal
RS174650 22 29883892 GAS2L1 ENSG00000185340.11 3.158E-6 0 181320 gtex_brain_putamen_basal
RS165743 22 29884277 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.971E-6 0 181705 gtex_brain_putamen_basal
RS5763269 22 29885473 GAS2L1 ENSG00000185340.11 3.214E-6 0 182901 gtex_brain_putamen_basal
RS165923 22 29885861 GAS2L1 ENSG00000185340.11 3.228e-6 0 183289 gtex_brain_putamen_basal
RS165625 22 29886413 GAS2L1 ENSG00000185340.11 3.242E-6 0 183841 gtex_brain_putamen_basal
RS165894 22 29887623 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.278E-6 0 185051 gtex_brain_putamen_basal
RS58197542 22 30121774 GAS2L1 ENSG00000185340.11 2.381E-6 0 419202 gtex_brain_putamen_basal
RS36573 22 30203919 GAS2L1 ENSG00000185340.11 3.011E-6 0 501347 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007050 细胞周期停滞 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
NOJIMA SFRP2靶向DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge缺氧DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和TP73的SCIAN细胞周期目标 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤IgLL与IgLK DN 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HALMOS CEBPA目标DN 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
糖尿病性肾病 86 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild SRC致癌特征 62 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射8G后的生存率不佳 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄Foxa2靶向DN 36 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集11 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng通过ERCC6 DN对H2O2的响应 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kamikubo Myeloid MN1网络 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ceribelli基因不活跃,受NFY的约束 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 156 162 M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-124.1 207 213 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 207 213 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-125/351 70 76 1a HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug
mir-133 109 115 M8 HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua