基因页:GAS2L1
概括?
基因 | 10634 |
象征 | GAS2L1 |
同义词 | GAR22 |
描述 | 增长逮捕比2这样的2 |
参考 | MIM:602128|HGNC:HGNC:16955|ENSEMBL:ENSG00000185340|HPRD:03676|Vega:Otthumg00000151108 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q12.2 |
Pascal P值 | 0.204 |
Sherlock P值 | 0.581 |
胎儿β | -1.219 |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS909798 | 22 | 29654004 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.729E-7 | 0 | -48568 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2857466 | 22 | 29657604 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 3.188e-7 | 0 | -44968 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2301291 | 22 | 29664423 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 5.214e-7 | 0 | -38149 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9613857 | 22 | 29679713 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.208E-7 | 0 | -22859 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3761426 | 22 | 29688632 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.227E-7 | 0 | -13940 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3747142 | 22 | 29693990 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 1.656E-7 | 0 | -8582 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2301586 | 22 | 29702910 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 4.668E-7 | 0 | 338 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9613859 | 22 | 29703409 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.774E-7 | 0 | 837 | gtex_brain_putamen_basal |
RS142333573 | 22 | 29706244 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.501E-7 | 0 | 3672 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9613860 | 22 | 29707955 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.025E-7 | 0 | 5383 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3216803 | 22 | 29708796 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 3.082e-7 | 0 | 6224 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71700945 | 22 | 29712522 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 1.092E-7 | 0 | 9950 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6006093 | 22 | 29719167 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.194E-8 | 0 | 16595 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9613863 | 22 | 29721902 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 3.548e-8 | 0 | 19330 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9613864 | 22 | 29728854 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 4.309E-8 | 0 | 26282 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3747146 | 22 | 29735310 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 9.375E-9 | 0 | 32738 | gtex_brain_putamen_basal |
RS715589 | 22 | 29743779 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 7.725e-9 | 0 | 41207 | gtex_brain_putamen_basal |
RS737883 | 22 | 29746253 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 5.014E-6 | 0 | 43681 | gtex_brain_putamen_basal |
RS174650 | 22 | 29883892 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 3.158E-6 | 0 | 181320 | gtex_brain_putamen_basal |
RS165743 | 22 | 29884277 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.971E-6 | 0 | 181705 | gtex_brain_putamen_basal |
RS5763269 | 22 | 29885473 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 3.214E-6 | 0 | 182901 | gtex_brain_putamen_basal |
RS165923 | 22 | 29885861 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 3.228e-6 | 0 | 183289 | gtex_brain_putamen_basal |
RS165625 | 22 | 29886413 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 3.242E-6 | 0 | 183841 | gtex_brain_putamen_basal |
RS165894 | 22 | 29887623 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.278E-6 | 0 | 185051 | gtex_brain_putamen_basal |
RS58197542 | 22 | 30121774 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 2.381E-6 | 0 | 419202 | gtex_brain_putamen_basal |
RS36573 | 22 | 30203919 | GAS2L1 | ENSG00000185340.11 | 3.011E-6 | 0 | 501347 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GAS2L1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0007050 | 细胞周期停滞 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
NOJIMA SFRP2靶向DN | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge缺氧DN | 146 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP53和TP73的SCIAN细胞周期目标 | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Magrangeas多发性骨髓瘤IgLL与IgLK DN | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HALMOS CEBPA目标DN | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
糖尿病性肾病 | 86 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild SRC致癌特征 | 62 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄Foxa2靶向DN | 36 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集11 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng通过ERCC6 DN对H2O2的响应 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kamikubo Myeloid MN1网络 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转化特征dn | 103 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ceribelli基因不活跃,受NFY的约束 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 156 | 162 | M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-124.1 | 207 | 213 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA | ||||
mir-124/506 | 207 | 213 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-125/351 | 70 | 76 | 1a | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||
mir-133 | 109 | 115 | M8 | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua |