基因页：lefty1
概括？
| 基因 | 10637 |
| 象征 | lefty1 |
| 同义词 | 左B | leftyb |
| 描述 | 左右测定因子1 |
| 参考 | MIM：603037|HGNC：HGNC：6552|ENSEMBL：ENSG00000243709|HPRD：09116|Vega：Otthumg0000000037443 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q42.1 |
| Sherlock P值 | 0.826 |
| 胎儿β | -0.316 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02477458 | 1 | 226112258 | lefty1 | 8.32e-9 | 0.006 | 3.93E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS360063 | CHR1 | 226036308 | lefty1 | 10637 | 0.03 | 顺式 | ||
| RS10158985 | CHR1 | 226050608 | lefty1 | 10637 | 0.16 | 顺式 | ||
| RS2493163 | CHR1 | 226131690 | lefty1 | 10637 | 0.02 | 顺式 | ||
| RS11583675 | CHR1 | 81400829 | lefty1 | 10637 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF518B | 0.96 | 0.96 |
| ZNF644 | 0.96 | 0.97 |
| ZNF606 | 0.96 | 0.96 |
| ZNF564 | 0.96 | 0.95 |
| ZNF84 | 0.96 | 0.97 |
| OXSR1 | 0.96 | 0.95 |
| AP001011.3 | 0.96 | 0.96 |
| ZNF776 | 0.95 | 0.95 |
| ZNF614 | 0.95 | 0.94 |
| ZNF354C | 0.95 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.74 | -0.89 |
| HLA-F | -0.73 | -0.79 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.88 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.87 |
| AF347015.27 | -0.72 | -0.85 |
| ifi27 | -0.72 | -0.87 |
| AIFM3 | -0.72 | -0.78 |
| AF347015.33 | -0.71 | -0.85 |
| TSC22D4 | -0.71 | -0.80 |
| S100B | -0.71 | -0.82 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 淋巴结的反应组信号传导 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tesar Alk靶向人ES 5D DN | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bhattacharya胚胎干细胞 | 89 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 苏胰腺 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 | 70 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hofmann骨髓增生综合征低风险 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 | 74 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 137 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanloo SP3靶向DN | 89 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kohoutek CCNT2目标 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |