基因页:CELF2
概括?
基因 | 10659 |
象征 | CELF2 |
同义词 | brunol3 | cugbp2 | etr-3 | etr3 | napor |
描述 | CUGBP,类似Elav的家庭成员2 |
参考 | MIM:602538|HGNC:HGNC:2550|ENSEMBL:ENSG0000000048740|HPRD:03964|Vega:Otthumg0000000017668 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10p13 |
Pascal P值 | 0.002 |
Sherlock P值 | 0.617 |
TADA P值 | 0.001 |
胎儿β | 1.193 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CELF2 | Chr10 | 11356223 | t | n | NM_001025076 NM_001025076 NM_001025077 NM_001025077 NM_001083591 NM_006561 NM_006561 |
。 。 。 。 p.335g>? 。 。 |
内含子 剪接唐纳2 内含子 剪接唐纳2 外来的不知名 内含子 剪接唐纳2 |
精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10508433 | Chr10 | 11869520 | CELF2 | 10659 | 0.06 | 顺式 | ||
RS10868543 | Chr9 | 89852686 | CELF2 | 10659 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CELF2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GFOD2 | 0.87 | 0.88 |
DGCR14 | 0.87 | 0.90 |
Carm1 | 0.87 | 0.90 |
CTBP1 | 0.87 | 0.89 |
Rab11b | 0.87 | 0.89 |
Rab35 | 0.86 | 0.89 |
BAT3 | 0.86 | 0.89 |
PRCC | 0.86 | 0.89 |
G6PD | 0.86 | 0.89 |
C7orf26 | 0.86 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.77 | -0.84 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.83 |
mt-cyb | -0.74 | -0.81 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.80 |
AF347015.8 | -0.73 | -0.82 |
AF347015.27 | -0.72 | -0.81 |
AF347015.21 | -0.70 | -0.83 |
鼻孔 | -0.70 | -0.79 |
AF347015.2 | -0.69 | -0.79 |
AF347015.15 | -0.69 | -0.79 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003723 | RNA结合 | 塔斯 | 9887331 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006397 | mRNA处理 | IEA | - | |
去:0008016 | 心脏收缩的调节 | 塔斯 | 9887331 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
冬季缺氧DN | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu肿瘤脉管系统DN | 13 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房正常导管与小叶 | 68 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 DN | 67 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2A DN | 141 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标DN | 124 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 | 108 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肯尼CTNNB1靶向 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC vs多能祖先 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up | 87 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿斯顿主要抑郁症 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙槽横纹肌肉瘤 | 98 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindvall因TERT DN永生 | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krasnoselskaya ILF3靶向DN | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee区分T淋巴细胞 | 200 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G5 DN | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARSON FOXP3目标 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gregory合成致死与伊马替尼 | 145 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir30目标 | 116 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-10 | 717 | 723 | M8 | HSA-MIR-10A | uacccuguagauccgaauuugug |
HSA-MIR-10B | uacccuguagaaccgaauuugu | ||||
mir-101 | 2121 | 2127 | 1a | HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag |
mir-103/107 | 1612 | 1618年 | 1a | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-129-5p | 2250 | 2256 | 1a | HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc |
HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcgguggggcuugcu | ||||
HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc | ||||
HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcgguggggcuugcu | ||||
HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc | ||||
HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcgguggggcuugcu | ||||
mir-132/212 | 7206 | 7212 | M8 | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
mir-134 | 5102 | 5108 | M8 | HSA-MIR-134脑 | ugugacuggugaccagaggg |
mir-137 | 1769年 | 1775年 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-142-3p | 550 | 556 | 1a | HSA-MIR-142-3P | uguaguuuccuacuuuaugga |
mir-144 | 2121 | 2127 | 1a | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag | ||||
mir-145 | 1147 | 1153 | M8 | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
mir-146 | 942 | 948 | M8 | HSA-MIR-146A | ugagaacugaauuccaugggug |
HSA-MIR-146B脑 | ugagaacugaauuccauaggcu | ||||
mir-153 | 7370 | 7376 | M8 | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
mir-155 | 5006 | 5012 | M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 5106 | 5112 | 1a | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-182 | 2442 | 2448 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-183 | 3480 | 3487 | 1A,M8 | HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug |
mir-196 | 2014 | 2020 | 1a | HSA-MIR-196A | uagguaguucauguugugug |
HSA-MIR-196B | uagguaguucuuguugg | ||||
mir-199 | 628 | 634 | M8 | HSA-MIR-199A | cccaguucagacuaccuguuc |
HSA-MIR-199B | cccaguguuuagacuaucuuc | ||||
MiR-200BC/429 | 1724年 | 1730年 | 1a | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu | ||||
mir-208 | 5020 | 5026 | 1a | HSA-MIR-208 | auaagacgaaaaaagcuugu |
HSA-MIR-208 | auaagacgaaaaaagcuugu | ||||
mir-214 | 3461 | 3467 | M8 | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
mir-216 | 4832 | 4838 | 1a | HSA-MIR-216 | uaaucucagcuggcaacugug |
mir-219 | 7177 | 7183 | 1a | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu | ||||
mir-23 | 1598年 | 1605 | 1A,M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc | ||||
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc | ||||
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-24 | 4746 | 4752 | 1a | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
mir-26 | 1717年 | 1723年 | 1a | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc | ||||
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
mir-299-5p | 5288 | 5294 | 1a | HSA-MIR-299-5P | ugguuuaccgucccacauacau |
mir-30-3p | 1629年 | 1635年 | M8 | HSA-MIR-30A-3P | cuuucagucggauguugcagc |
HSA-MIR-30E-3P | cuuucagucggauguauacagc | ||||
mir-30-5p | 3776 | 3782 | M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-323 | 1598年 | 1604 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu | ||||
HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu | ||||
mir-324-3p | 1891年 | 1897年 | M8 | HSA-MIR-324-3P | ccacugccccaggugcugcugg |
mir-326 | 2802 | 2808 | M8 | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |
mir-33 | 1262 | 1268 | 1a | HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug |
HSA-MIR-33B | Gugcauugcuguugcauugca | ||||
HSA-MIR-33 | Gugcauuguuguugcauug | ||||
HSA-MIR-33B | Gugcauugcuguugcauugca | ||||
mir-339 | 4300 | 4306 | 1a | HSA-MIR-339 | ucccuccuccaggagcuca |
HSA-MIR-339 | ucccuccuccaggagcuca | ||||
mir-34/449 | 417 | 423 | M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
mir-340 | 116 | 122 | M8 | HSA-MIR-340 | uccgucucuuacuuauauagcc |
mir-342 | 2489 | 2495 | 1a | HSA-MIR-342脑 | ucucacacagaaaucgcacccccguc |
mir-34b | 878 | 884 | M8 | HSA-MIR-34B | uaggcagugucauagcugauug |
HSA-MIR-34B | uaggcagugucauagcugauug | ||||
mir-361 | 7148 | 7154 | 1a | HSA-MIR-361脑 | uuaucagaaucuccagggguac |
mir-376 | 1579年 | 1585年 | 1a | HSA-MIR-376A | aucauagaaaaauccacgu |
HSA-MIR-376B | aucauagaaaaauccauguu | ||||
mir-377 | 5253 | 5259 | M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
mir-378 | 7197 | 7203 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu | ||||
mir-381 | 2531 | 2537 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu | ||||
mir-384 | 992 | 998 | M8 | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |
mir-410 | 7409 | 7415 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
mir-411 | 5207 | 5214 | 1A,M8 | HSA-MIR-411 | aacacgguccacuaacccucagu |
mir-431 | 1624年 | 1630 | M8 | HSA-MIR-431 | uguugcaggccguauga |
mir-433-5p | 1010 | 1016 | M8 | HSA-MIR-433-5p | UACGGGUGAGCCUGUCAUUUUC |
mir-450 | 3689 | 3695 | 1a | HSA-MIR-450 | uuuuugcgauguuccuaaua |
mir-451 | 119 | 125 | 1a | HSA-MIR-451脑 | aaaccguuaccauuacugugaguuu |
mir-452 | 359 | 365 | 1a | HSA-MIR-452 | UguuugcaggaaacugagaC |
mir-486 | 2106 | 2113 | 1A,M8 | HSA-MIR-486 | uccuguacugagcugcccccgag |
mir-493-5p | 2104 | 2110 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
mir-494 | 754 | 760 | M8 | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |
mir-495 | 643 | 649 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu | ||||
mir-499 | 5020 | 5026 | 1a | HSA-MIR-499 | uuaagacuugcagugauguuaa |
HSA-MIR-499 | uuaagacuugcagugauguuaa | ||||
mir-539 | 1934年 | 1940年 | 1a | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |
HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu | ||||
mir-543 | 1792年 | 1798年 | M8 | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 523 | 530 | 1A,M8 | HSA-MIR-93脑 | aaagugcuguucgugcagguag |
HSA-MIR-302A | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
HSA-MIR-302C | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
HSA-MIR-520B | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
HSA-MIR-520C | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
HSA-MIR-520D | aaaguguuugugggguggguu | ||||
mir-96 | 2441 | 2448 | 1A,M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |