概括
基因 10659
象征 CELF2
同义词 brunol3 | cugbp2 | etr-3 | etr3 | napor
描述 CUGBP,类似Elav的家庭成员2
参考 MIM:602538|HGNC:HGNC:2550|ENSEMBL:ENSG0000000048740|HPRD:03964|Vega:Otthumg0000000017668
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10p13
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.617
TADA P值 0.001
胎儿β 1.193
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
CELF2 Chr10 11356223 t n NM_001025076
NM_001025076
NM_001025077
NM_001025077
NM_001083591
NM_006561
NM_006561




p.335g>?

内含子
剪接唐纳2
内含子
剪接唐纳2
外来的不知名
内含子
剪接唐纳2
精神分裂症 DNM:XU_2012

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10508433 Chr10 11869520 CELF2 10659 0.06 顺式
RS10868543 Chr9 89852686 CELF2 10659 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GFOD2 0.87 0.88
DGCR14 0.87 0.90
Carm1 0.87 0.90
CTBP1 0.87 0.89
Rab11b 0.87 0.89
Rab35 0.86 0.89
BAT3 0.86 0.89
PRCC 0.86 0.89
G6PD 0.86 0.89
C7orf26 0.86 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.77 -0.84
AF347015.31 -0.77 -0.83
mt-cyb -0.74 -0.81
AF347015.33 -0.73 -0.80
AF347015.8 -0.73 -0.82
AF347015.27 -0.72 -0.81
AF347015.21 -0.70 -0.83
鼻孔 -0.70 -0.79
AF347015.2 -0.69 -0.79
AF347015.15 -0.69 -0.79

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 塔斯 9887331
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006397 mRNA处理 IEA -
去:0008016 心脏收缩的调节 塔斯 9887331
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
冬季缺氧DN 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu肿瘤脉管系统DN 13 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房正常导管与小叶 68 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 DN 67 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标DN 124 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 108 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肯尼CTNNB1靶向 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC vs多能祖先 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙槽横纹肌肉瘤 98 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall因TERT DN永生 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krasnoselskaya ILF3靶向DN 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4 DN的响应 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞 200 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G5 DN 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 134 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标 116 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-10 717 723 M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-101 2121 2127 1a HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-103/107 1612 1618年 1a HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-129-5p 2250 2256 1a HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-132/212 7206 7212 M8 HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
HSA-MIR-132 uaacagucuacccaugggg
mir-134 5102 5108 M8 HSA-MIR-134 ugugacuggugaccagaggg
mir-137 1769年 1775年 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-142-3p 550 556 1a HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-144 2121 2127 1a HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-145 1147 1153 M8 HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-146 942 948 M8 HSA-MIR-146A ugagaacugaauuccaugggug
HSA-MIR-146B ugagaacugaauuccauaggcu
mir-153 7370 7376 M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-155 5006 5012 M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 5106 5112 1a HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-182 2442 2448 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-183 3480 3487 1A,M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-196 2014 2020 1a HSA-MIR-196A uagguaguucauguugugug
HSA-MIR-196B uagguaguucuuguugg
mir-199 628 634 M8 HSA-MIR-199A cccaguucagacuaccuguuc
HSA-MIR-199B cccaguguuuagacuaucuuc
MiR-200BC/429 1724年 1730年 1a HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-208 5020 5026 1a HSA-MIR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
HSA-MIR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
mir-214 3461 3467 M8 HSA-MIR-214 acagcaggcacagacaggcag
mir-216 4832 4838 1a HSA-MIR-216 uaaucucagcuggcaacugug
mir-219 7177 7183 1a HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
HSA-MIR-219 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-23 1598年 1605 1A,M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-24 4746 4752 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-26 1717年 1723年 1a HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-299-5p 5288 5294 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-30-3p 1629年 1635年 M8 HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-30-5p 3776 3782 M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-323 1598年 1604 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-324-3p 1891年 1897年 M8 HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
mir-326 2802 2808 M8 HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-33 1262 1268 1a HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-339 4300 4306 1a HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-34/449 417 423 M8 HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-340 116 122 M8 HSA-MIR-340 uccgucucuuacuuauauagcc
mir-342 2489 2495 1a HSA-MIR-342 ucucacacagaaaucgcacccccguc
mir-34b 878 884 M8 HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
mir-361 7148 7154 1a HSA-MIR-361 uuaucagaaucuccagggguac
mir-376 1579年 1585年 1a HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-377 5253 5259 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-378 7197 7203 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-381 2531 2537 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-384 992 998 M8 HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-410 7409 7415 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-411 5207 5214 1A,M8 HSA-MIR-411 aacacgguccacuaacccucagu
mir-431 1624年 1630 M8 HSA-MIR-431 uguugcaggccguauga
mir-433-5p 1010 1016 M8 HSA-MIR-433-5p UACGGGUGAGCCUGUCAUUUUC
mir-450 3689 3695 1a HSA-MIR-450 uuuuugcgauguuccuaaua
mir-451 119 125 1a HSA-MIR-451 aaaccguuaccauuacugugaguuu
mir-452 359 365 1a HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-486 2106 2113 1A,M8 HSA-MIR-486 uccuguacugagcugcccccgag
mir-493-5p 2104 2110 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-494 754 760 M8 HSA-MIR-494 ugaaacauacgggaaaccucuu
mir-495 643 649 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-499 5020 5026 1a HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa
HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa
mir-539 1934年 1940年 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-543 1792年 1798年 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 523 530 1A,M8 HSA-MIR-93 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu
mir-96 2441 2448 1A,M8 HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc