基因页面:LBX1
总结吗?
| GeneID | 10660年 |
| 象征 | LBX1 |
| 同义词 | HPX-6 | HPX6 | LBX1H |同源框 |
| 描述 | 瓢虫同源框1 |
| 参考 | MIM: 604255|HGNC: HGNC: 16960|HPRD: 09178| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10抓起 |
| 帕斯卡假定值 | 0.01 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:4 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZNF24 | 0.93 | 0.95 |
| USP38 | 0.91 | 0.92 |
| KLHL28 | 0.91 | 0.92 |
| XPO4 | 0.90 | 0.92 |
| CEP97 | 0.90 | 0.91 |
| LMAN1 | 0.90 | 0.92 |
| PPP4R2 | 0.89 | 0.90 |
| ZNF451 | 0.89 | 0.91 |
| SOCS4 | 0.89 | 0.93 |
| ADAM10 | 0.89 | 0.88 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.62 | -0.66 |
| IFI27 | -0.60 | -0.66 |
| AC018755.7 | -0.60 | -0.63 |
| MT-CO2 | -0.60 | -0.65 |
| AF347015.21 | -0.60 | -0.66 |
| CXCL14 | -0.59 | -0.65 |
| HIGD1B | -0.58 | -0.65 |
| MYL3 | -0.57 | -0.60 |
| AF347015.31 | -0.56 | -0.63 |
| AF347015.8 | -0.56 | -0.62 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003700 | 转录因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0043565 | sequence-specific DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0048664 | 神经元命运决定 | 国际能源机构 | 神经元(词级:10) | - - - - - - |
| 去:0045665 | 负调节神经元分化 | 国际能源机构 | 神经元(词级:10) | - - - - - - |
| 去:0007519 | 骨骼肌发展 | 国际能源机构 | 神经元(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | 国际能源机构 | 神经突(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0001947 | 心脏循环 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008285 | 负调节细胞增殖 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009653 | 解剖结构形态发生 | 助教 | 8645601 | |
| 去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005667 | 转录因子复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| BORCZUK恶性间皮瘤DN | 104年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过SMAD4 JAZAG TGFB1信号 | 108年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李老化小脑DN | 86年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐gh外源目标DN | 120年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K27ME3 | 269年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森和HCP H3K27ME3 IPS | 102年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 137 | 165年 | 172年 | 1、m8 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
| miR-25/32/92/363/367 | 237年 | 243年 | m8 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| mir - 363 | 236年 | 242年 | m8 | hsa - mir - 363 | AUUGCACGGUAUCCAUCUGUAA |