基因页:fars2
概括?
基因 | 10667 |
象征 | fars2 |
同义词 | coxpd14 | fars1 | hspc320 | phers |
描述 | 苯基丙烷基-TRNA合成酶2,线粒体 |
参考 | MIM:611592|HGNC:HGNC:21062|ENSEMBL:ENSG00000145982|HPRD:09946|Vega:Otthumg0000000014178 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6p25.1 |
Pascal P值 | 0.012 |
Sherlock P值 | 0.189 |
胎儿β | -0.29 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0159 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23817779 | 6 | 5261046 | lyrm4; fars2 | 1.691E-4 | -0.347 | 0.033 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FARS2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PIP5K2B | 0.89 | 0.91 |
AP003115.1 | 0.88 | 0.91 |
NOLC1 | 0.88 | 0.89 |
PUM1 | 0.88 | 0.89 |
SLC35E1 | 0.87 | 0.89 |
trim32 | 0.87 | 0.88 |
RNF111 | 0.87 | 0.89 |
AP1G1 | 0.87 | 0.89 |
polr3a | 0.87 | 0.90 |
DCTN5 | 0.87 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.83 |
MT-CO2 | -0.76 | -0.82 |
higd1b | -0.75 | -0.82 |
FXYD1 | -0.74 | -0.80 |
mt-cyb | -0.73 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.72 | -0.77 |
ifi27 | -0.72 | -0.77 |
AF347015.21 | -0.71 | -0.83 |
AC021016.1 | -0.71 | -0.77 |
CST3 | -0.71 | -0.77 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000049 | tRNA结合 | 艾达 | 10329163 | |
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004826 | 苯丙氨酸-tRNA连接酶活性 | 艾达 | 10329163 | |
去:0004826 | 苯丙氨酸-tRNA连接酶活性 | IEA | - | |
GO:0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006432 | 苯基烷基-TRNA氨基酰化 | 艾达 | 10329163 | |
去:0006432 | 苯基烷基-TRNA氨基酰化 | IEA | - | |
去:0006412 | 翻译 | IEA | - | |
去:0008033 | tRNA处理 | 艾达 | 10329163 | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005625 | 可溶性部分 | 艾达 | 10329163 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
去:0005759 | 线粒体基质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg氨基酰基tRNA生物合成 | 41 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome线粒体tRNA氨基酰化 | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome tRNA氨基酰化 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gajate对Trabectedin DN的响应 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林黑色素瘤复制号码 | 73 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 | 109 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇12的时间反应12 | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF持续DN | 61 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |