概括
基因 10667
象征 fars2
同义词 coxpd14 | fars1 | hspc320 | phers
描述 苯基丙烷基-TRNA合成酶2,线粒体
参考 MIM:611592|HGNC:HGNC:21062|ENSEMBL:ENSG00000145982|HPRD:09946|Vega:Otthumg0000000014178
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p25.1
Pascal P值 0.012
Sherlock P值 0.189
胎儿β -0.29

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0159
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23817779 6 5261046 lyrm4; fars2 1.691E-4 -0.347 0.033 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PIP5K2B 0.89 0.91
AP003115.1 0.88 0.91
NOLC1 0.88 0.89
PUM1 0.88 0.89
SLC35E1 0.87 0.89
trim32 0.87 0.88
RNF111 0.87 0.89
AP1G1 0.87 0.89
polr3a 0.87 0.90
DCTN5 0.87 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.77 -0.83
MT-CO2 -0.76 -0.82
higd1b -0.75 -0.82
FXYD1 -0.74 -0.80
mt-cyb -0.73 -0.79
AF347015.33 -0.72 -0.77
ifi27 -0.72 -0.77
AF347015.21 -0.71 -0.83
AC021016.1 -0.71 -0.77
CST3 -0.71 -0.77

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000049 tRNA结合 艾达 10329163
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004826 苯丙氨酸-tRNA连接酶活性 艾达 10329163
去:0004826 苯丙氨酸-tRNA连接酶活性 IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006432 苯基烷基-TRNA氨基酰化 艾达 10329163
去:0006432 苯基烷基-TRNA氨基酰化 IEA -
去:0006412 翻译 IEA -
去:0008033 tRNA处理 艾达 10329163
去:0006810 运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005625 可溶性部分 艾达 10329163
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005759 线粒体基质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg氨基酰基tRNA生物合成 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome线粒体tRNA氨基酰化 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome tRNA氨基酰化 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gajate对Trabectedin DN的响应 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林黑色素瘤复制号码 73 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 109 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇12的时间反应12 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF持续DN 61 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因