基因页：GNA13

概括?
GeneID 10672
Symbol GNA13
同义词 G13
描述 G蛋白亚基Alpha 13
参考 MIM:604406|HGNC：HGNC：4381|HPRD:05100|
Gene type protein-coding
地图位置 17q24.3
Pascal P值 1.378E-4
Sherlock P值 0.407
Fetal beta 1.28
DMG 1（＃研究）
支持 G-PROTEIN RELAY
COMPOSITESET

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.1115

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
CG23423852 17 63053202 GNA13 8.55e-9 0.005 3.98E-6 DMG:Jaffe_2016


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0004871 signal transducer activity IEA -
去：0003924 GTPase活性 塔斯 7791744
GO:0005515 protein binding IPI 10026210
GO:0005525 GTP结合 IEA -
GO:0019001 guanyl nucleotide binding IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0001569 血管 IEA -
GO:0001701 in utero embryonic development IEA -
去：0007186 G-protein coupled receptor protein signaling pathway IEA -
去：0007266 RHO蛋白信号转导 IEA -
去：0007243 protein kinase cascade IEA -
去：0007165 signal transduction 塔斯 7791744
去：0030168 platelet activation IEA -
去：0008360 细胞形状调节 IEA -
去：0006928 细胞运动 塔斯 8999798
去：0030154 cell differentiation IEA -
GO:0030334 regulation of cell migration IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0016020 膜 IEA -
GO：0042470 黑色素体 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
AKAP3 AKAP110 | FSP95 | PRKA3 | SOB1 激酶（PRKA）锚蛋白3 - HPRD，Biogrid 11696326
Arhgef1 GEF1 | LBCL2 | LSC | P115-RHOGEF | SUB1.5 Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）1 - HPRD 9641916
Arhgef1 GEF1 | LBCL2 | LSC | P115-RHOGEF | SUB1.5 Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）1 GNA13(alpha-13) interacts with ARHGEF1 (p115RhoGEF). BIND 15735747
Arhgef1 GEF1 | LBCL2 | LSC | P115-RHOGEF | SUB1.5 Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）1 - HPRD，Biogrid 9641916|12681510
Arhgef11 DKFZp667F1223 | GTRAP48 | KIAA0380 | PDZ-RHOGEF Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）11 - HPRD，Biogrid 10026210
Arhgef12 DKFZp686O2372 | KIAA0382 | LARG | PRO2792 Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）12 - HPRD，Biogrid 11094164
CDH1 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO 钙粘蛋白1，1型，e-钙粘蛋白（上皮） - HPRD，Biogrid 11136230
CDH2 CD325 |CDHN |CDW325 |NCAD 钙粘蛋白2，1型，N-钙粘蛋白（神经元） - HPRD，Biogrid 11136230
CTNNB1 CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa - HPRD 11136230
DRD5 DBDR | DRD1B | DRD1L2 | MGC10601 dopamine receptor D5 - HPRD，Biogrid 12623966
EDNRB abcds |ETB |etbr |ETRB |HSCR |HSCR2 内皮素受体型B型 - HPRD 12135322
F2R CF2R | HTR | PAR1 | TR 凝结因子II（凝血酶）受体 Affinity Capture-Western BioGRID 8290554
MCF2 DBL MCF.2细胞系导出转换序列 in vitro
体内		 BioGRID 11062019
MTNR1A MEL-1A-R | MT1 melatonin receptor 1A - HPRD 10598579
PPP5C FLJ36922 |pp5 |PPP5 蛋白质磷酸酶5，催化亚基 GNA13（Alpha-13）与PPP5C（PP5）相互作用。 BIND 15735747
PPP5C FLJ36922 |pp5 |PPP5 蛋白质磷酸酶5，催化亚基 - HPRD，Biogrid 12176367
prkar2A MGC3606 |PKR2 |prkar2 蛋白激酶，cAMP依赖性，调节性，II型，α Affinity Capture-Western BioGRID 11696326
PRKCB MGC41878 | PKC-beta | PKCB | PRKCB1 | PRKCB2 protein kinase C, beta - HPRD，Biogrid 8824244
PRKCD MAY1 | MGC49908 | PKCD | nPKC-delta protein kinase C, delta - HPRD，Biogrid 8824244
PRKCE MGC125656 | MGC125657 | PKCE | nPKC-epsilon protein kinase C, epsilon - HPRD，Biogrid 8824244
ptk2b CADTK | CAKB | FADK2 | FAK2 | FRNK | PKB | PTK | PYK2 | RAFTK PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β - HPRD，Biogrid 10821841
RDX DFNB24 radixin Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 10816569
RGS16 A28-RGS14 | A28-RGS14P | RGS-R regulator of G-protein signaling 16 - HPRD，Biogrid 14634662
RIC8A MGC104517 |MGC131931 |MGC148073 |MGC148074 |ric8 |Synembryn resistance to inhibitors of cholinesterase 8 homolog A (C. elegans) - HPRD，Biogrid 12509430
S1PR2 AGR16 |EDG-5 |EDG5 |GPCR13 |H218 |LPB2 |S1P2 鞘氨醇1-磷酸受体2 - HPRD 10488065
S1pr3 EDG-3 |EDG3 |FLJ37523 |FLJ93220 |LPB3 |MGC71696 |S13 鞘氨醇1-磷酸受体3 - HPRD 10488065
TBXA2R TXA2-R thromboxane A2 receptor - HPRD，Biogrid 8290554 | 10395940
tec MGC126760 |MGC126762 |PSCTK4 TEC蛋白酪氨酸激酶 Phenotypic Enhancement BioGRID 12515866
TSHR CHNG1 | LGR3 | MGC75129 | hTSHR-I 甲状腺刺激激素受体 - HPRD 8552586


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
kegg血管平滑肌收缩 115 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LONG TERM DEPRESSION 70 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MYOSIN PATHWAY 31 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AKAP13 PATHWAY 12 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PAR1 PATHWAY 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St GA13途径 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ER非原始组途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P3 PATHWAY 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P4途径 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TXA2 Pathway 57 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID THROMBIN PAR4 PATHWAY 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AJDISS 2PATHWAY 48 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P META PATHWAY 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID THROMBIN PAR1 PATHWAY 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P2途径 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha1213信号传导事件 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNAL AMPLIFICATION 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME THROMBOXANE SIGNALLING THROUGH TP RECEPTOR 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过蛋白酶激活受体PAR的反应组凝血酶信号传导 32 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与导管正常 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN 74 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS UP 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王攀登目标DN 186 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC应对氧化磷脂上杉达也TYELLOW UP 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS BLUE UP 136 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC2 TARGETS UP 114 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schramm Inhba目标DN 24 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA MYELOID DIFFERENTIATION DN 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSE HYPOXIA UP 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR UP 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 16HR UP 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG VHL TARGETS 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SU THYMUS 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染8小时 105 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH DN的响应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG HYPOXIA NORMAL 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向DN 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO NORMAL TISSUE ADJACENT TO LIVER TUMOR UP 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST STROMAL STIMULATION DN 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标 116 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rao由Sall4绑定 227 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-124.1 2681 2687 m8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 2681 2687 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
hsa-miR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-30-5p 615 621 1a hsa-miR-30a-5p uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
hsa-miR-30a-5p uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga