概括
基因 10683
象征 dll3
同义词 SCDO1
描述 三角洲3(果蝇)
参考 MIM:602768|HGNC:HGNC:2909|Ensembl:ENSG0000000090932|HPRD:04140|Vega:Otthumg00000183067
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13
Pascal P值 0.013
Sherlock P值 0.315
胎儿β 1.135
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01519877 19 39989802 dll3 2.73E-5 -0.367 0.018 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PDIA2 0.64 0.64
AL117190.3 0.63 0.69
PNPLA7 0.63 0.60
石灰1 0.62 0.62
Acadvl 0.61 0.61
HSF4 0.58 0.60
TBC1D2 0.57 0.55
ITIH4 0.57 0.60
ACCN3 0.57 0.54
TBC1D10C 0.56 0.57
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
USP9Y -0.43 -0.46
lypla1 -0.43 -0.50
nlgn4y -0.41 -0.41
ZFY -0.41 -0.46
ddx3y -0.41 -0.44
GPD2 -0.41 -0.47
Azin1 -0.40 -0.47
ube2d3 -0.40 -0.48
PTP4A1 -0.40 -0.44
GNB4 -0.40 -0.44

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Notch信号通路 47 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Notch途径 59 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海登布拉德在胰腺癌中扩增 31 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Guenther生长球形与粘附 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LSD1目标DN 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质癌与腺瘤 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuuselo胰腺癌19Q13扩增 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
福岛TNFSF11目标 16 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标3 DN 39 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因