基因页:dll3
概括?
基因 | 10683 |
象征 | dll3 |
同义词 | SCDO1 |
描述 | 三角洲3(果蝇) |
参考 | MIM:602768|HGNC:HGNC:2909|Ensembl:ENSG0000000090932|HPRD:04140|Vega:Otthumg00000183067 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13 |
Pascal P值 | 0.013 |
Sherlock P值 | 0.315 |
胎儿β | 1.135 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01519877 | 19 | 39989802 | dll3 | 2.73E-5 | -0.367 | 0.018 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DLL3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PDIA2 | 0.64 | 0.64 |
AL117190.3 | 0.63 | 0.69 |
PNPLA7 | 0.63 | 0.60 |
石灰1 | 0.62 | 0.62 |
Acadvl | 0.61 | 0.61 |
HSF4 | 0.58 | 0.60 |
TBC1D2 | 0.57 | 0.55 |
ITIH4 | 0.57 | 0.60 |
ACCN3 | 0.57 | 0.54 |
TBC1D10C | 0.56 | 0.57 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
USP9Y | -0.43 | -0.46 |
lypla1 | -0.43 | -0.50 |
nlgn4y | -0.41 | -0.41 |
ZFY | -0.41 | -0.46 |
ddx3y | -0.41 | -0.44 |
GPD2 | -0.41 | -0.47 |
Azin1 | -0.40 | -0.47 |
ube2d3 | -0.40 | -0.48 |
PTP4A1 | -0.40 | -0.44 |
GNB4 | -0.40 | -0.44 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Notch信号通路 | 47 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Notch途径 | 59 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海登布拉德在胰腺癌中扩增 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Guenther生长球形与粘附 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LSD1目标DN | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质癌与腺瘤 | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kuuselo胰腺癌19Q13扩增 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记 | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
福岛TNFSF11目标 | 16 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标3 DN | 39 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |