基因页:GMEB1
概括?
基因 | 10691 |
象征 | GMEB1 |
同义词 | P96PIF | PIF96 |
描述 | 糖皮质激素调节元件结合蛋白1 |
参考 | MIM:604409|HGNC:HGNC:4370|ENSEMBL:ENSG00000162419|HPRD:16059|Vega:Otthumg00000003647 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p35.3 |
Pascal P值 | 0.007 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | GMEB1 | 10691 | 0.01 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | GMEB1 | 10691 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GMEB1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
COG7 | 0.87 | 0.86 |
Acad10 | 0.86 | 0.85 |
FAM160B2 | 0.85 | 0.87 |
Rhot2 | 0.85 | 0.86 |
CDK9 | 0.84 | 0.85 |
SH2B1 | 0.83 | 0.86 |
ZNF839 | 0.83 | 0.84 |
NDST2 | 0.83 | 0.83 |
TUBGCP6 | 0.83 | 0.86 |
ATP8B2 | 0.83 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.66 | -0.60 |
AF347015.31 | -0.63 | -0.54 |
MT-CO2 | -0.60 | -0.52 |
GNG11 | -0.58 | -0.57 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.50 |
C1orf54 | -0.57 | -0.56 |
AF347015.27 | -0.57 | -0.51 |
mt-cyb | -0.56 | -0.48 |
clec2b | -0.55 | -0.58 |
AF347015.2 | -0.53 | -0.48 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由Kras Pten Up | 181 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chung水泡细胞毒性 | 134 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |