基因页:科林
概括?
基因 | 10699 |
象征 | 科林 |
同义词 | atc2 | crn | lrp4 | pee5 | tmprss10 |
描述 | 科林,丝氨酸肽酶 |
参考 | MIM:605236|HGNC:HGNC:19012|ENSEMBL:ENSG00000145244|HPRD:05573|Vega:Otthumg0000000099441 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P12 |
Pascal P值 | 0.235 |
胎儿β | -0.215 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CORIN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ISOC1 | 0.86 | 0.83 |
NDN | 0.82 | 0.84 |
SUMO3 | 0.82 | 0.82 |
CTNNB1 | 0.81 | 0.81 |
PRMT6 | 0.81 | 0.82 |
WRB | 0.81 | 0.78 |
WRNIP1 | 0.81 | 0.86 |
C5orf30 | 0.81 | 0.77 |
GPR137C | 0.80 | 0.77 |
ARF1 | 0.80 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.66 | -0.67 |
AF347015.33 | -0.63 | -0.65 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.67 |
AF347015.31 | -0.63 | -0.65 |
mt-cyb | -0.62 | -0.65 |
AF347015.2 | -0.62 | -0.63 |
AF347015.21 | -0.61 | -0.62 |
AF347015.26 | -0.60 | -0.63 |
AF347015.15 | -0.59 | -0.63 |
FXYD1 | -0.59 | -0.60 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | 塔斯 | 谷氨酸(GO期限:7) | 10880574 |
去:0005044 | 清道夫受体活性 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | 塔斯 | 10880574 | |
去:0008217 | 血压调节 | 塔斯 | 10880574 | |
去:0009653 | 解剖结构形态发生 | 塔斯 | 10329693 | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | 塔斯 | 10329693 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 10329693|10880574 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 10329693 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta GCR途径 | 22 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
jazag tgfb1发出信号 | 108 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung可卡因奖励4WK | 75 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向低血清 | 100 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-138 | 1365 | 1372 | 1A,M8 | HSA-MIR-138脑 | Agcugguuguguugaauc |