概括
基因 10699
象征 科林
同义词 atc2 | crn | lrp4 | pee5 | tmprss10
描述 科林,丝氨酸肽酶
参考 MIM:605236|HGNC:HGNC:19012|ENSEMBL:ENSG00000145244|HPRD:05573|Vega:Otthumg0000000099441
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P12
Pascal P值 0.235
胎儿β -0.215

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ISOC1 0.86 0.83
NDN 0.82 0.84
SUMO3 0.82 0.82
CTNNB1 0.81 0.81
PRMT6 0.81 0.82
WRB 0.81 0.78
WRNIP1 0.81 0.86
C5orf30 0.81 0.77
GPR137C 0.80 0.77
ARF1 0.80 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.66 -0.67
AF347015.33 -0.63 -0.65
AF347015.8 -0.63 -0.67
AF347015.31 -0.63 -0.65
mt-cyb -0.62 -0.65
AF347015.2 -0.62 -0.63
AF347015.21 -0.61 -0.62
AF347015.26 -0.60 -0.63
AF347015.15 -0.59 -0.63
FXYD1 -0.59 -0.60

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 塔斯 谷氨酸(GO期限:7) 10880574
去:0005044 清道夫受体活性 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 塔斯 10880574
去:0008217 血压调节 塔斯 10880574
去:0009653 解剖结构形态发生 塔斯 10329693
去:0006629 脂质代谢过程 塔斯 10329693
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005886 质膜 塔斯 10329693|10880574
去:0005887 质膜的积分 塔斯 10329693

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta GCR途径 22 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung可卡因奖励4WK 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向低血清 100 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-138 1365 1372 1A,M8 HSA-MIR-138 Agcugguuguguugaauc