基因页：TBR1
概括？
| 基因 | 10716 |
| 象征 | TBR1 |
| 同义词 | TBR-1 | TES-56 |
| 描述 | T-box，大脑1 |
| 参考 | MIM：604616|HGNC：HGNC：11590|HPRD：07055| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2Q24 |
| Pascal P值 | 0.254 |
| 胎儿β | 1.074 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SNX3 | 0.61 | 0.63 |
| GNG3 | 0.61 | 0.67 |
| pts | 0.60 | 0.68 |
| PSMG1 | 0.59 | 0.66 |
| XRCC6BP1 | 0.59 | 0.64 |
| ATP6V0B | 0.59 | 0.61 |
| mettl11a | 0.59 | 0.62 |
| pnoc | 0.59 | 0.71 |
| NGB | 0.58 | 0.58 |
| TPI1 | 0.58 | 0.62 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| tenc1 | -0.38 | -0.43 |
| SLC27A1 | -0.35 | -0.38 |
| PHLDB1 | -0.33 | -0.30 |
| GP1BA | -0.32 | -0.36 |
| AC010618.2 | -0.32 | -0.36 |
| FAM38A | -0.32 | -0.34 |
| Rapgef3 | -0.31 | -0.35 |
| mtss1l | -0.31 | -0.38 |
| hip1r | -0.31 | -0.28 |
| PSD2 | -0.30 | -0.31 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 7619531 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007411 | 轴突指导 | IEA | Axon（GO期限：13） | - |
| 去：0030902 | 后脑发展 | IEA | 大脑（GO期限：8） | - |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| GO：0045944 | RNA聚合酶II启动子的转录阳性调节 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Delta FOSB目标2WK | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bacolod抗烷基化剂DN | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hofmann骨髓增生综合征低风险 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-141/200a | 542 | 548 | 1a | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
| HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| mir-27 | 523 | 529 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| mir-375 | 514 | 520 | 1a | HSA-MIR-375 | uuuguucguucggcucgcguga |