基因页:NRG3
概括?
基因 | 10718 |
象征 | NRG3 |
同义词 | HRG3 | Pro-NRG3 |
描述 | Neuregulin 3 |
参考 | MIM:605533|HGNC:HGNC:7999|ENSEMBL:ENSG00000185737|HPRD:16115|Vega:Otthumg0000000018626 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q23.1 |
Pascal P值 | 0.009 |
胎儿β | -0.328 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | 神经营养蛋白信号传导 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04529370 | 10 | 83635300 | NRG3 | 4.22e-10 | -0.016 | 7.8e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NRG3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008083 | 生长因子活性 | nas | 9275162 | |
去:0030971 | 受体酪氨酸激酶结合 | nas | 9275162 | |
去:0030297 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激活剂活性 | nas | 9275162 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001558 | 细胞生长调节 | nas | 9275162 | |
去:0007243 | 蛋白激酶级联反应 | IEA | - | |
去:0009790 | 胚胎发展 | IEA | - | |
GO:0030879 | 乳腺发育 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | nas | 9275162 | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | nas | 9275162 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg erbb信号通路 | 87 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta AGR途径 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB4途径 | 38 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB网络途径 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MF DN | 41 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |