概括
基因 10718
象征 NRG3
同义词 HRG3 | Pro-NRG3
描述 Neuregulin 3
参考 MIM:605533|HGNC:HGNC:7999|ENSEMBL:ENSG00000185737|HPRD:16115|Vega:Otthumg0000000018626
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q23.1
Pascal P值 0.009
胎儿β -0.328
DMG 1(#研究)
支持 神经营养蛋白信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04529370 10 83635300 NRG3 4.22e-10 -0.016 7.8e-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008083 生长因子活性 nas 9275162
去:0030971 受体酪氨酸激酶结合 nas 9275162
去:0030297 跨膜受体蛋白酪氨酸激活剂活性 nas 9275162
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001558 细胞生长调节 nas 9275162
去:0007243 蛋白激酶级联反应 IEA -
去:0009790 胚胎发展 IEA -
GO:0030879 乳腺发育 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 nas 9275162
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 nas 9275162

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg erbb信号通路 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta AGR途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB4途径 38 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB网络途径 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MF DN 41 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因