基因页：ptges3
Summary？
| 基因 | 10728 |
| 象征 | ptges3 |
| Synonyms | P23|TEBP|cPGES |
| Description | prostaglandin E synthase 3 |
| Reference | MIM：607061|HGNC:HGNC:16049|Ensembl：ENSG00000110958|HPRD:06138|Vega：Otthumg00000170217 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| Map location | 12q13.3 | 12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.302 |
| Sherlock p-value | 0.037 |
| 胎儿β | 0.242 |
| 主持人 | Myers' cis & trans |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | High-throughput literature-search | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| Literature | High-throughput literature-search | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | 点击显示详细信息 |
| Network | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献：0.0742 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2403775 | CHR8 | 133472361 | ptges3 | 10728 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PDYN | 0.60 | 0.63 |
| 兰布 | 0.58 | 0.63 |
| CDH9 | 0.56 | 0.62 |
| mpp7 | 0.56 | 0.72 |
| KCTD8 | 0.56 | 0.75 |
| VSTM2A | 0.55 | 0.70 |
| AC134043.1 | 0.54 | 0.20 |
| EBF1 | 0.53 | 0.29 |
| flrt3 | 0.53 | 0.48 |
| hexb | 0.53 | 0.71 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| EMID1 | -0.38 | -0.40 |
| metrnl | -0.35 | -0.48 |
| CBS | -0.33 | -0.38 |
| SLA | -0.30 | -0.16 |
| WDR86 | -0.30 | -0.32 |
| CSRP2 | -0.30 | -0.48 |
| klhl1 | -0.30 | -0.14 |
| SNX7 | -0.29 | -0.20 |
| TBC1D10A | -0.29 | -0.30 |
| TMEM108 | -0.29 | -0.20 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0003720 | telomerase activity | 艾达 | 12135483 | |
| GO:0016853 | 异构酶活性 | IEA | - | |
| GO：0050220 | 前列腺素-e合酶活性 | 艾达 | 10922363 | |
| GO：0051082 | unfolded protein binding | 艾达 | 12077419 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0000723 | 端粒维护 | TAS | 12135483 | |
| 去：0001516 | 前列腺素生物合成过程 | 艾达 | 10922363 | |
| 去：0007165 | 信号转导 | TAS | 8114727 | |
| 去：0006633 | 脂肪酸生物合成过程 | IEA | - | |
| Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0000781 | chromosome, telomeric region | 我知道了 | 12135483 | |
| 去：0005697 | telomerase holoenzyme complex | 艾达 | 12135483 | |
| 去：0005737 | cytoplasm | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 啊 | - | 芳基烃受体 | - | HPRD | 11013261|11259606 |
| arnt | hif-1beta |HIF1B |hif1beta |探戈|bhlhe2 | 芳基烃受体核转运剂 | - | HPRD | 11879970 |
| arnt | hif-1beta |HIF1B |hif1beta |探戈|bhlhe2 | 芳基烃受体核转运剂 | 重构的复合物 | Biogrid | 11259606 |
| COPG | copg1 |FLJ21068 | 涂层蛋白复合物，亚基伽玛 | - | HPRD,BioGRID | 11056392 |
| COPG2 | 2-cop |DKFZP761N09121 |FLJ11781 | 涂层蛋白复合物，亚基伽马2 | - | HPRD,BioGRID | 11056392 |
| DNAJB1 | HSPF1 |HDJ1 |HSP40 |SIS1 | DNAJ（HSP40）同源物，亚家族B，成员1 | - | HPRD | 11809754 |
| EIF2AK2 | EIF2AK1 |MGC126524 |PKR |prkr | 真核翻译起始因子2-α激酶2 | - | HPRD,BioGRID | 11447118 |
| ERBB3 | ErbB-3 | HER3 | LCCS2 | MDA-BF-1 | MGC88033 | c-erbB-3 | c-erbB3 | erbB3-S | p180-ErbB3 | p45-sErbB3 | p85-sErbB3 | V-ERB-B2红细胞白血病病毒癌基因同源物3（Avian） | - | HPRD | 10095121 |
| ESR1 | DKFZp686N23123 | ER | ESR | ESRA | Era | NR3A1 | estrogen receptor 1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9222609 |
| ESR1 | DKFZp686N23123 | ER | ESR | ESRA | Era | NR3A1 | estrogen receptor 1 | - | HPRD | 10207098 |
| FES | FPS | 猫科动物肉瘤 | 重构的复合物 | Biogrid | 9222609 |
| HSF1 | HSTF1 | 热休克转录因子1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9222609 |
| HSP90AA1 | FLJ31884 |HSP86 |HSP89A |HSP90A |HSP90N |HSPC1 |HSPCA |HSPCAL1 |HSPCAL4 |HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class A member 1 | - | HPRD,BioGRID | 11812147|12077419 |
| HSPA4 | APG-2 |HS24/p52 |MGC131852 |Ry |HSP70 |HSP70RY | 热休克70KDA蛋白4 | 体内 | Biogrid | 12077419 |
| NR3C1 | GCCR |GCR |gr |grl | 核受体亚科3，C组，成员1（糖皮质激素受体） | - | HPRD,BioGRID | 10691735 |
| NR3C2 | MCR | MGC133092 | MLR | MR | 核受体亚科3，C组，成员2 | - | HPRD,BioGRID | 10691735 |
| stip1 | 跳|IEF-SSP-3521 |p60 |sti1 |sti1l | 应力诱导的磷蛋白1 | - | HPRD | 11809754 |
| Tert | EST2 |TCS1 |TP2 |trt |hest2 | 端粒酶逆转录酶 | - | HPRD,BioGRID | 11274138 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-141/200a | 538 | 544 | M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
| hsa-miR-200a | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| miR-186 | 853 | 859 | M8 | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
| miR-24* | 262 | 268 | 1a | HSA-MIR-189 | Gugccuacugagagauaucagu |