概括
基因 10738
象征 RFPL3
同义词 -
描述 RET手指蛋白像3
参考 MIM:605970|HGNC:HGNC:9980|ENSEMBL:ENSG00000128276|HPRD:09339|Vega:Otthumg00000030290
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q12.3
Pascal P值 0.191
Sherlock P值 0.192
胎儿β -0.073
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS137547 CHR22 33311454 RFPL3 10738 0 顺式
RS2611410 CHR3 60399847 RFPL3 10738 0.06 反式
RS10739219 Chr9 108938328 RFPL3 10738 1.089E-4 反式
RS1324669 CHR13 107872446 RFPL3 10738 0.01 反式
RS6132977 CHR20 2825971 RFPL3 10738 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 塔斯 10508838
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
XU HGF靶向Akt1 DN抑制 95 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ceribelli基因不活跃,受NFY的约束 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因