基因页:RFPL3
概括?
基因 | 10738 |
象征 | RFPL3 |
同义词 | - |
描述 | RET手指蛋白像3 |
参考 | MIM:605970|HGNC:HGNC:9980|ENSEMBL:ENSG00000128276|HPRD:09339|Vega:Otthumg00000030290 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q12.3 |
Pascal P值 | 0.191 |
Sherlock P值 | 0.192 |
胎儿β | -0.073 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS137547 | CHR22 | 33311454 | RFPL3 | 10738 | 0 | 顺式 | ||
RS2611410 | CHR3 | 60399847 | RFPL3 | 10738 | 0.06 | 反式 | ||
RS10739219 | Chr9 | 108938328 | RFPL3 | 10738 | 1.089E-4 | 反式 | ||
RS1324669 | CHR13 | 107872446 | RFPL3 | 10738 | 0.01 | 反式 | ||
RS6132977 | CHR20 | 2825971 | RFPL3 | 10738 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RFPL3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | 塔斯 | 10508838 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ceribelli基因不活跃,受NFY的约束 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |