概括
基因 10741
象征 RBBP9
同义词 沼泽| RBBP10
描述 视网膜细胞瘤结合蛋白9
参考 MIM:602908|HGNC:HGNC:9892|Ensembl:ENSG00000089050|HPRD:04217|Vega:Otthumg0000000031972
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20p11.2
Pascal P值 0.649
Sherlock P值 0.039
胎儿β 1.121
主持人 小脑半球

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.046

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MDP1 0.90 0.81
UQCRQ 0.89 0.80
NDUFB4 0.89 0.77
MRPL21 0.89 0.79
DDT 0.88 0.79
hax1 0.88 0.79
UCRC 0.88 0.81
MRPL54 0.88 0.80
C14orf2 0.88 0.77
MRPS15 0.88 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
myh9 -0.54 -0.52
mtss1l -0.46 -0.48
BAT2D1 -0.44 -0.40
Caskin2 -0.43 -0.49
Z83840.4 -0.43 -0.48
mmrn2 -0.42 -0.39
CDH5 -0.41 -0.43
CCDC55 -0.40 -0.39
PDGFRB -0.40 -0.44
Znhit6 -0.40 -0.35

第三节。基因本体论注释

细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦特自动甲状腺腺瘤 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANASSE BCL2靶向DN 74 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因