基因页:RBBP9
概括?
基因 | 10741 |
象征 | RBBP9 |
同义词 | 沼泽| RBBP10 |
描述 | 视网膜细胞瘤结合蛋白9 |
参考 | MIM:602908|HGNC:HGNC:9892|Ensembl:ENSG00000089050|HPRD:04217|Vega:Otthumg0000000031972 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20p11.2 |
Pascal P值 | 0.649 |
Sherlock P值 | 0.039 |
胎儿β | 1.121 |
主持人 | 小脑半球 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.046 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RBBP9_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MDP1 | 0.90 | 0.81 |
UQCRQ | 0.89 | 0.80 |
NDUFB4 | 0.89 | 0.77 |
MRPL21 | 0.89 | 0.79 |
DDT | 0.88 | 0.79 |
hax1 | 0.88 | 0.79 |
UCRC | 0.88 | 0.81 |
MRPL54 | 0.88 | 0.80 |
C14orf2 | 0.88 | 0.77 |
MRPS15 | 0.88 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
myh9 | -0.54 | -0.52 |
mtss1l | -0.46 | -0.48 |
BAT2D1 | -0.44 | -0.40 |
Caskin2 | -0.43 | -0.49 |
Z83840.4 | -0.43 | -0.48 |
mmrn2 | -0.42 | -0.39 |
CDH5 | -0.41 | -0.43 |
CCDC55 | -0.40 | -0.39 |
PDGFRB | -0.40 | -0.44 |
Znhit6 | -0.40 | -0.35 |
第三节。基因本体论注释
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005634 | 核 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
瓦特自动甲状腺腺瘤 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VANASSE BCL2靶向DN | 74 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |