基因页：PHTF1
概括？
| 基因 | 10745 |
| 象征 | PHTF1 |
| 同义词 | PHTF |
| 描述 | 推定同源域转录因子1 |
| 参考 | MIM：604950|HGNC：HGNC：8939|Ensembl：ENSG00000116793|HPRD：09227|Vega：Otthumg00000011800 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1P13 |
| Pascal P值 | 0.415 |
| Sherlock P值 | 0.467 |
| 胎儿β | 0.452 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG01580044 | 1 | 114300656 | PHTF1 | 3.184e-4 | 0.544 | 0.04 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17745470 | CHR4 | 57080197 | PHTF1 | 10745 | 0.14 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | PHTF1 | 10745 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C20ORF175 | 0.75 | 0.63 |
| C7orf63 | 0.71 | 0.53 |
| AC023055.4 | 0.71 | 0.62 |
| AC015724.2 | 0.70 | 0.55 |
| GDPD2 | 0.70 | 0.56 |
| DNAH11 | 0.70 | 0.31 |
| STK33 | 0.70 | 0.64 |
| Sult1c4 | 0.70 | 0.62 |
| WDR52 | 0.69 | 0.52 |
| GLB1L | 0.69 | 0.62 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GPR22 | -0.31 | -0.28 |
| MEF2C | -0.29 | -0.26 |
| klhl1 | -0.29 | -0.17 |
| IER5L | -0.28 | -0.24 |
| mpped1 | -0.26 | -0.22 |
| Neurod6 | -0.26 | -0.23 |
| SATB2 | -0.26 | -0.24 |
| NDRG1 | -0.25 | -0.18 |
| DPP4 | -0.25 | -0.24 |
| LMO7 | -0.25 | -0.16 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| 去：0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 10729229 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM MYCL1扩增靶向DN | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应20 MCF10A | 14 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| palomero gsi敏感性 | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |