基因页面:CHL1
总结吗?
| GeneID | 10752年 |
| 象征 | CHL1 |
| 同义词 | 电话| L1CAM2 |
| 描述 | 细胞粘附分子L1 |
| 参考 | MIM: 607416|HGNC: HGNC: 1939|运用:ENSG00000134121|HPRD: 07598|织女:OTTHUMG00000090601 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 p26.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.833 |
| 胎儿β | 0.27 |
| eGene | 小脑半球 小脑 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 2 | 链接到SZGene |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1387353 | chr1 | 164414740 | CHL1 | 10752年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs7084863 | chr10 | 6753797 | CHL1 | 10752年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs13083233 | 3 | 161782年 | CHL1 | ENSG00000134121.5 | 3.28753 e-6 | 0.04 | -76497年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 单边带 | 0.86 | 0.86 |
| PRPF18 | 0.83 | 0.82 |
| DNTTIP2 | 0.83 | 0.84 |
| BCCIP | 0.83 | 0.80 |
| SYF2 | 0.82 | 0.82 |
| DDX50 | 0.82 | 0.80 |
| SUMO1 | 0.82 | 0.81 |
| RIOK2 | 0.82 | 0.84 |
| SRP54 | 0.81 | 0.83 |
| DNAJC8 | 0.81 | 0.78 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.15 | -0.62 | -0.65 |
| AF347015.27 | -0.62 | -0.63 |
| AF347015.33 | -0.62 | -0.64 |
| AF347015.2 | -0.62 | -0.66 |
| AF347015.8 | -0.62 | -0.63 |
| MT-CO2 | -0.61 | -0.63 |
| AF347015.31 | -0.61 | -0.63 |
| MT-CYB | -0.61 | -0.63 |
| AF347015.9 | -0.57 | -0.63 |
| AF347015.21 | -0.57 | -0.56 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007399 | 神经系统发育 | 国际能源机构 | 神经突(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0007155 | 细胞粘附 | 助教 | 9799093 | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 9799093 | |
| 去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005578 | 蛋白质的细胞外基质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 助教 | 9799093 | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 开回应前列腺素E2 DN | 391年 | 222年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TURASHVILI乳腺导管癌与导管正常的DN | 198年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TURASHVILI乳腺小叶癌和小叶正常 | 94年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SILIGAN受EWS FLT1融合 | 47 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YORDY相互监管ETS1和SP100 DN | 87年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LE EGR2目标了 | 108年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃晚期造血祖 | 544年 | 307年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KAAB心脏心房和心室 | 249年 | 170年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MODY海马新生儿 | 35 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过NOVA2 ULE拼接 | 43 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 克劳克兰龋齿DN | 245年 | 144年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 克劳克兰蛀牙了 | 253年 | 147年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伽马辐射KYNG DNA损伤 | 81年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KYNG DNA损伤了 | 226年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由喀斯特IWANAGA致癌PTEN | 181年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌等正常 | 476年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCGARVEY甲基化沉默的结肠癌 | 42 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑胶质母细胞瘤可塑性高 | 250年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞起 | 260年 | 174年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞培养与新鲜的DN | 31日 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 纳特GBM VS AO神经胶质瘤 | 46 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的肺癌喀斯特 | 491年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒30分钟DN | 150年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 | 682年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 前川ATF2目标 | 24 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SERVITJA胰岛HNF1A目标 | 163年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO FGFR1在前列腺癌模型的目标 | 289年 | 184年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |