概括
基因 10758
象征 traf3ip2
同义词 act1 | c6orf2 | c6orf4 | c6orf5 | c6orf6 | candf8 | ciks | psors13
描述 TRAF3相互作用蛋白2
参考 MIM:607043|HGNC:HGNC:1343|Ensembl:ENSG00000056972|HPRD:06129|Vega:Otthumg0000000015379
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q21
Pascal P值 3.145e-5
Sherlock P值 0.826
胎儿β -0.44
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24634333 6 111887834 traf3ip2 3.317E-4 -0.591 0.041 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
aph1a 0.91 0.88
PPP4C 0.91 0.91
TARBP2 0.90 0.93
SPNS1 0.90 0.86
TSEN34 0.90 0.90
lman2 0.90 0.90
HN1 0.90 0.91
RPN2 0.90 0.91
MAGED1 0.89 0.91
杜拉德 0.89 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.74 -0.85
AF347015.33 -0.73 -0.86
MT-CO2 -0.73 -0.84
mt-cyb -0.73 -0.86
AF347015.8 -0.72 -0.86
AF347015.31 -0.72 -0.82
AF347015.15 -0.71 -0.85
AF347015.2 -0.70 -0.86
HLA-F -0.69 -0.73
AF347015.26 -0.68 -0.85

第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007242 细胞内信号传导级联 nas 10962033
GO:0043123 I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 IEP 12761501
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005575 cellular_component nd -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scheidereit IKK相互作用蛋白 58 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井与中度DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs供体DN 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSS AML与AML1 ETO融合 76 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时DN 101 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因