基因页:traf3ip2
概括?
基因 | 10758 |
象征 | traf3ip2 |
同义词 | act1 | c6orf2 | c6orf4 | c6orf5 | c6orf6 | candf8 | ciks | psors13 |
描述 | TRAF3相互作用蛋白2 |
参考 | MIM:607043|HGNC:HGNC:1343|Ensembl:ENSG00000056972|HPRD:06129|Vega:Otthumg0000000015379 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q21 |
Pascal P值 | 3.145e-5 |
Sherlock P值 | 0.826 |
胎儿β | -0.44 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24634333 | 6 | 111887834 | traf3ip2 | 3.317E-4 | -0.591 | 0.041 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRAF3IP2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
aph1a | 0.91 | 0.88 |
PPP4C | 0.91 | 0.91 |
TARBP2 | 0.90 | 0.93 |
SPNS1 | 0.90 | 0.86 |
TSEN34 | 0.90 | 0.90 |
lman2 | 0.90 | 0.90 |
HN1 | 0.90 | 0.91 |
RPN2 | 0.90 | 0.91 |
MAGED1 | 0.89 | 0.91 |
杜拉德 | 0.89 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.85 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.86 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.84 |
mt-cyb | -0.73 | -0.86 |
AF347015.8 | -0.72 | -0.86 |
AF347015.31 | -0.72 | -0.82 |
AF347015.15 | -0.71 | -0.85 |
AF347015.2 | -0.70 | -0.86 |
HLA-F | -0.69 | -0.73 |
AF347015.26 | -0.68 | -0.85 |
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0007242 | 细胞内信号传导级联 | nas | 10962033 | |
GO:0043123 | I-kappab激酶/NF-kappab级联的积极调节 | IEP | 12761501 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005575 | cellular_component | nd | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Scheidereit IKK相互作用蛋白 | 58 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 | 110 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井与中度DN | 110 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs供体DN | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ROSS AML与AML1 ETO融合 | 76 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时DN | 101 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病35D UP | 131 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoelzel NF1靶向 | 139 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |