基因页：POP4
概括？
| 基因 | 10775 |
| 象征 | POP4 |
| 同义词 | RPP29 |
| 描述 | POP4同源物，核糖核酸酶P/MRP亚基 |
| 参考 | MIM：606114|HGNC：HGNC：30081|ENSEMBL：ENSG00000105171|HPRD：09358|Vega：Otthumg00000182020 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q12 |
| Pascal P值 | 0.861 |
| Sherlock P值 | 0.188 |
| 胎儿β | -0.587 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG22560837 | 19 | 30097072 | POP4 | 1.076E-4 | 0.824 | 0.028 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2948491 | Chrx | 40180688 | POP4 | 10775 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ube2n | 0.89 | 0.87 |
| Rab11a | 0.89 | 0.86 |
| 是的 | 0.88 | 0.88 |
| C11orf58 | 0.88 | 0.86 |
| C16orf94 | 0.88 | 0.85 |
| ptges3 | 0.88 | 0.87 |
| C10orf84 | 0.87 | 0.84 |
| PSMD10 | 0.87 | 0.87 |
| UBA3 | 0.87 | 0.86 |
| SCCPDH | 0.87 | 0.85 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.68 | -0.64 |
| AF347015.2 | -0.67 | -0.66 |
| AF347015.33 | -0.66 | -0.63 |
| mt-cyb | -0.66 | -0.63 |
| AF347015.26 | -0.65 | -0.63 |
| AF347015.8 | -0.65 | -0.62 |
| AF347015.9 | -0.63 | -0.65 |
| AF347015.15 | -0.63 | -0.62 |
| FXYD1 | -0.63 | -0.64 |
| AF347015.31 | -0.63 | -0.61 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 用VH3 21 DN的FAELT B CLL | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vandesluis正常胚胎DN | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |