SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

基因	10776
象征	Arpp19
Synonyms	arpp-16 \| arpp-19 \| arpp16 \| insal
Description	cAMP调节磷蛋白19KDA
Reference	MIM：605487\|HGNC：HGNC：16967\|Ensembl:ENSG00000128989\|HPRD：09264\|Vega：Otthumg00000172677
基因类型	蛋白质编码
地图中心tion	15Q21.2
Pascal P值	1.375E-4
Sherlock p-value	0.537
DEG P值	DEG：Maycox_2009：cc_ba10_fold_change = -1.12：cc_ba10_disease_p = 0.0041：hbb_ba9_fold_change = -1.20：hbb_ba9_disease_p = 0.0030
胎儿β	-1.447
DMG	1 (# studies)
主持人	小脑 Hypothalamus

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DEG：Maycox_2009	Microarray to determine the expression of over 30000 mRNA transcripts in post-mortem tissue	我们包括了51个基因，其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。
DMG：JAFFE_2016	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。	2

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

探针	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
CG03799220	15	52860635	Arpp19	2.4E-8	-0.03	7.84e-6	DMG：JAFFE_2016
CG23865067	15	52860622	Arpp19	7.07e-8	-0.015	1.7e-5	DMG：JAFFE_2016

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005102	受体结合	艾达	神经递质（GO期限：4）	9653196
GO：0015459	钾通道调节剂活性	艾达		9653196
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO：0045722	positive regulation of gluconeogenesis	艾达		9653196
GO:0046326	葡萄糖进口的积极调节	nas		9653196
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005737	cytoplasm	IEA		-

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
通过CD40 UP的Hollmann凋亡	201	125	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS	332	228	All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病	1382	904	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LAIHO大肠癌锯齿状的	112	71	All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌DN	406	230	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bidus转移	214	134	All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN	1375	806	All SZGR 2.0 genes in this pathway
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤	177	113	All SZGR 2.0 genes in this pathway
pDGFB DN的Johansson神经胶质作用	21	16	All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过ELK3 UP总缺氧	209	139	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUYTTEN NIPP1 TARGETS DN	848	527	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUYTTEN EZH2 TARGETS DN	1024	594	All SZGR 2.0 genes in this pathway
buytaert光动力疗法压力	811	508	All SZGR 2.0 genes in this pathway
WEI mir34a目标	148	97	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标	775	494	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS	882	572	All SZGR 2.0 genes in this pathway
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡	314	201	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn	1237	837	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞	681	420	All SZGR 2.0 genes in this pathway
RAMASWAMY METASTASIS UP	66	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
江口大脑皮层DN	54	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向	673	430	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53靶向	602	364	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向	601	369	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌	973	570	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上	863	514	All SZGR 2.0 genes in this pathway
张乳腺癌祖细胞	425	253	All SZGR 2.0 genes in this pathway
对Salirasib dn的Blum响应	342	220	All SZGR 2.0 genes in this pathway
WANG TUMOR INVASIVENESS UP	374	247	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌的生存率差A6	456	285	All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标36小时DN	185	116	All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足	518	299	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE UP	442	263	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G3 UP	188	121	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO LIVER DEVELOPMENT UP	166	105	All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束	1103	714	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病Calb1 Corr Up	548	370	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN	1972	1213	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标2 DN	336	211	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向DN	784	464	All SZGR 2.0 genes in this pathway
FOSTER KDM1A TARGETS DN	211	119	All SZGR 2.0 genes in this pathway
巨噬细胞的库马尔病原体负荷	275	155	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kumar自噬网络	71	46	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 1类由EGF瞬时诱导	516	308	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
Let-7/98	2259	2266	1A，M8	hsa-let-7a^brain	ugagguaguaguauauaguu
				hsa-let-7b^brain	ugagguaguagguuguguguguu
				hsa-let-7c^brain	ugagguaguagguuguaugguu
				hsa-let-7d^brain	AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
				hsa-let-7e^brain	ugagguaggagguuauauagu
				hsa-let-7f^brain	ugagguagauuguauauaguu
				HSA-MIR-98^brain	ugagguaaguuguauuguu
				hsa-let-7g^SZ	ugagguaguuguuguacagu
				hsa-let-7i^brain	ugagguaguugugugugugcugu
mir-124.1	514	520	1a	HSA-MIR-124A	UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-148/152	180	186	M8	HSA-MIR-148A	ucagugcacuacaacuuugu
				HSA-MIR-152^brain	UCAGUGCAUGACACUUGGG
				HSA-MIR-148B	ucagugcaucacacaacuuugu
miR-153	1007	1013	M8	HSA-MIR-153	UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
miR-183	708	714	M8	HSA-MIR-183	uauggcacugguagaauucacug
mir-19	733	740	1A，M8	HSA-MIR-19A	ugugcaaauaugauaugaaaacuga
mir-19	733	740	1A，M8	HSA-MIR-19B	UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir-218	802	809	1A，M8	hsa-miR-218^brain	UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
mir-23	663	669	1a	HSA-MIR-23A^brain	AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
mir-23	663	669	1a	HSA-MIR-23B^brain	aucacauugccagggauuacc
mir-26	2995	3001	M8	HSA-MIR-26A^brain	UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
mir-26	2995	3001	M8	HSA-MIR-26B^SZ	UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-27	2282	2288	1a	HSA-MIR-27A^brain	uucacaguggcuaaguuccgc
mir-27	2282	2288	1a	HSA-MIR-27B^brain	uucacaguggcuaaguucugc
mir-29	2458	2464	M8	HSA-MIR-29A^SZ	uagcaccaucugaaaucgguu
				HSA-MIR-29B^SZ	UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
				HSA-MIR-29C^SZ	uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-3p	893	899	M8	HSA-MIR-30A-3P	CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC
mir-30-3p	893	899	M8	HSA-MIR-30E-3P	cuuucagucggauguauacagc
mir-30-5p	863	869	1a	HSA-MIR-30A-5P	uguaaaacauccuccugagaag
				hsa-miR-30c^brain	UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
				hsa-miR-30d^SZ	UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
				hsa-miR-30b^SZ	uguaaacauccuaccucucagcu
				hsa-miR-30e-5p	UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir-320	529	536	1A，M8	hsa-miR-320	aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-320	529	536	1A，M8	hsa-miR-320	aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-410	1058	1064	1a	hsa-miR-410	aauauaacacagauggcugu
mir-505	655	661	1a	HSA-MIR-505	gucaacuugcugguuccuc
mir-539	39	45	M8	hsa-miR-539	GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU
mir-544	1010	1016	M8	hsa-miR-544	auucugcauuuuuuagcaagu
mir-544	1010	1016	M8	hsa-miR-544	auucugcauuuuuuagcaagu
mir-96	791	797	M8	HSA-MIR-96^brain	uuuggcacuagcacauuuuugc

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：Arpp19